简介：摘要目的应用腺相关病毒(AAV)-规律间隔成簇短回文重复序列及其相关核酸酶9(CRISPR/Cas9)系统体外实验研究基因治疗威尔森氏症(WD)。方法选用2月龄雄性Toxic milk (TX)小鼠作WD模型，设计小向导RNA(sgRNA)并构建含有CRISPR元件的AAV载体质粒命名为pAAV-sgRNA1、2、3，制备AAV，病毒滴度达1～4×1013 GC/ml；感染WD肝细胞，72 h后提取基因组DNA，聚合酶链反应(PCR)后测序检测基因编辑效率，筛选出其中活性最高者sgRNA1，构建相应的同源修复模板(HT)质粒命名为pAAV-HT，应用AAV-sgRNA1和AAV-HT共感染WD肝细胞，测序和T7E1酶切检测模板修复效率；用HT特异性引物行PCR，验证HT掺入。组间比较采用Student’s t检验。结果Sanger测序结果显示，sgRNA1在体外有最高的编辑效率[(20.2±2.3)%]，与sgRNA2、3比较[(3.1±1.3)%、(14.6±2.0)%]，差异有统计学意义(P<0.05)。进一步用HT进行基因修正，能检出特异性修正后的ATP7B基因；二代测序测序显示修复率为(7.9±2.7)%。结论AAV-CRISPR系统在体外可以达到较高编辑效率和修复效率。

简介：摘要目的应用规律间隔成簇短回文重复序列及其相关核酸酶9系统(CRISPR/Cas9)体外实验研究修正威尔森氏症(WD)基因。方法选用来源于DL近交系小鼠的Toxic milk小鼠(购自美国Jackson Laboratory公司)作WD模型，设计3个CRISPR来源的RNA (crRNA)-crRNA001/002/003，应用CRISPR/Cas9核糖核蛋白复合物(RNP)方法转染WD肝细胞，48 h后提取基因组DNA，聚合酶链反应(PCR)后测序检测基因编辑效率，筛选出效率最高者crRNA001，并设计相应的单链寡核苷酸(ssODN)修复模板；用crRNA001和ssODN共转染肝细胞，模板特异性引物行PCR，验证ssODN掺入。组间比较采用Student’S t检验。结果Sanger测序结果显示，crRNA001的编辑效率为(57.8±5.1)%。用ssODN共转染细胞后，模板特异性引物行PCR，能扩增出修正后的铜离子转运ATP酶β肽(ATP7B)基因条带；二代测序结果显示，ATP7B基因修复效率为(7.45±2.54)%。结论CRISPR/Cas9 RNP转染能达到较高编辑效率，相应的ssODN可以高效修复缺陷ATP7B基因，为进一步的体内实验提供理论和实验基础。

简介：摘要成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白基因（CRISPR/Cas）系统，作为一种新兴的基因编辑系统，根据Cas蛋白的数量可分为一类系统和二类系统。二类系统中的CRISPR/Cas9仅借助Cas9蛋白和单链向导RNA即可对目标核酸进行切割，是目前应用最为广泛的CRISPR/Cas系统。除了基因编辑在遗传病治疗中的应用，CRISPR/Cas系统衍生出的多种技术在疾病相关基因的筛查、基因表达调控、病原微生物的快速检测和防治等领域也展现了巨大的应用前景。本文就CRISPR/Cas系统的发现历程及其衍生的几个主要技术的应用进行总结，旨在为生命科学领域研究人员提供参考。

简介：摘要作为新一代的基因编辑技术，规律成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated proteins，CRISPR/Cas)系统具有强大的基因编辑功能，已被应用于许多领域。目前，已开发的规律成簇的间隔短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated protein, Cas)9、Cas12、Cas13和Cas14检测系统被广泛应用于传染病病原体的核酸检测，具有检测成本低、操作简单、灵敏度高等优点。本研究介绍了CRISPR/Cas系统的发展史、作用机制，以及几种Cas蛋白在传染病相关病原核酸检测中的应用。

简介：摘要目的研究甘肃省鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）的规律成簇的间隔短回文重复序列（CRISPR）位点多态性及地区分布。方法选取1962-2014年分离的203株鼠疫菌，培养并提取DNA。采用3对CRISPR引物对菌株DNA进行PCR扩增，对PCR产物进行测序。根据菌株CRISPR位点的间区序列种类和排列情况，确定菌株的基因型（类群），采用BioNumerics 5.10软件进行聚类分析。结果203株鼠疫菌发现有16种间区序列，包括YPa位点9种、YPb位点4种、YPc位点3种，发现新的间区序列a1′。共发现5个CRISPR基因簇，分别为Cb2、Ca7、Ca7′、CaΔ5′、Ca35′。不同的基因簇呈现区域性特征：Cb2主要分布在会宁县、平川区，Ca7主要分布阿克塞哈萨克族自治县；Ca7′主要分布在夏河县；Ca35′主要分布肃北蒙古族自治县、玉门市；CaΔ5′主要集中在肃南裕固族自治县。结论CRISPR分子分型方法能够较好地区分甘肃省不同疫源地的菌株，且各基因簇呈现一定的区域性特征。对研究甘肃省鼠疫菌进化规律和人间疫情分子生物学溯源有一定意义。

简介：摘要病理诊断向来就是诊断疾病的"金标准"，正确的病理诊断有助于临床治疗方案的制定和预后的判断。然而由于临床病理诊断工作非常繁杂，偶有不慎，可能会出现标本缺失、张冠李戴、蜡块内混入其他组织等病理技术上的差错。法医物证中的个体识别除了广泛用于灾难事故、交通事故和失踪人口的身份认定、刑事案件中对犯罪嫌疑人的同一认定外，还可以应用于医疗卫生领域，如医源性的病理切片、蜡块的同一认定，肿瘤组织来源的确认，造血干细胞移植前后供体与受体的基因型比对等。该文就其中心鉴定的3个案例做一分析，并谈谈如何利用短串联重复序列（STR）分型图谱甄别正确的组织病理标本。

简介：摘要长链非编码核糖核酸(lncRNAs)在恶性肿瘤发生和发展的调控中发挥重要作用，为多种肿瘤治疗研究中新的靶点。常间回文重复序列丛集(CRISPR)/CRISPR关联蛋白系统(Cas)系统为新近发展的高效精准的基因组编辑工具。多项研究表明CRISPR/Cas系统可靶向lncRNAs，为肿瘤细胞lncRNAs表达的调控提供了新策略。本文针对CRISPR/Cas技术调控lncRNA功能的机制及其在恶性肿瘤研究中的进展进行综述。

简介：结直肠癌是我国最常见的恶性肿瘤之一，其发病机制与多种肿瘤基因密切相关。锚蛋白重复序列（Gannankyrinrepeats，Gankyrin）是近年来新发现的癌基因，目前研究表明它在肝细胞癌及很多恶性肿瘤中高表达。近年研究表明Gankyrin与结直肠癌的发病密切相关，但对Gankyrin在结直肠癌的发病机制尚不清楚，对Gankyrin蛋白在结直肠癌肝转移灶中是否表达尚未见报道。本文就Gankyrin蛋白在结直肠癌中的研究进展情况作做一综述。

简介：目的探讨血液透析患者脂代谢紊乱的临床特征及低密度脂蛋白受体相关蛋白（LRp）5＇端四核苷酸重复序列基因多态性对脂代谢的影响.方法比较血液透析组患者（112例）与对照组（372例）血清TC、TG、HDL-C、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）、载脂蛋白（Apo）A1、ApoB、ApoE及脂蛋白（Lp）（a）水平,聚合酶链反应-限制性片断长度方法检测LRP5＇端四核苷酸重复序列基因多态性.结果血液透析组脂代谢紊乱主要表现为血清TG水平显著增高,HDL-C水平显著降低.血清TG水平高于正常者为37例（33.0%）,HDL-C低于正常者为12例（10.7%）.血液透析组高血压的发生率为73.6%（78/106）,心血管疾病为25.0%（26/104）.伴心血管疾病患者TG水平显著高于无心血管疾病患者,伴高血压患者与无高血压患者血脂水平差异无统计学意义.基因多态性分析显示,LRP5＇端四核苷酸重复序列基因型91/91、91/87与等位基因91bp频率较高,2组间差异无统计学意义.血液透析组LRP5＇端四核苷酸重复序列不同基因型间血脂水平差异无统计学意义.结论TG水平与血清白蛋白水平、透析时体外循环血流量显著相关;HDL-C与尿素清除指数显著相关.LRP5＇端四核苷酸重复序列基因多态性对血液透析患者血脂水平无显著影响.

简介：目的：筛选与癌性锚蛋白重复序列（Gankyrin）相互作用的蛋白。方法：构建诱饵（Bait）质粒pGB-Psmd10-1，采用β-半乳糖苷酶滤膜分析检测其自身转录活性，以Bait质粒筛选人Hela细胞MATCHMAKERcDNA文库，共转染重复验证阳性克隆，并测序鉴定。结果：成功构建Bait质粒，经验证对报告基因LacZ无自激活作用。以Bait质粒筛选人Hela细胞cDNA文库，获得83个克隆，其中5个克隆经重复验证确定为阳性克隆，测序结果显示其cDNA为Psmc4的3段不同剪接体（NM_006503．2，NM＿153001．1）。结论：在人Hela细胞中，Psmc4为与Cankyrin相互作用的蛋白。

简介：作为一种新型分子标记，表达序列标签一简单重复序列（EST—SSR）来自表达基因，因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外，还与基因功能表达具有直接或间接的关系，从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记的开发策略、方法及其应用进展，总结了其中存在的一些问题，目的是为今后该领域的研究提供一定的参考。

简介：摘要目的探讨糖蛋白A为主重复序列蛋白(glycoprotein A repetitions predominant，GARP)通过调节性T细胞(regulatory T cell，Treg)参与调控结核病发病的作用，以期为结核病治疗提供新靶点。方法纳入2021年1月至9月复旦大学附属华山医院和无锡市第五人民医院收治的60例活动性肺结核患者，同时招募6例结核潜伏感染患者和16名健康对照者。应用流式细胞术检测入组对象外周血淋巴细胞中Treg的占比，以及Treg上GARP和转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1，TGF-β1)的表达。统计学分析采用曼-惠特尼U检验。结果60例活动性肺结核患者中，23例未进行抗结核药物治疗，17例患者治疗<3个月，10例患者治疗3～<6个月，10例患者治疗≥6个月。活动性肺结核未治疗组CD4+CD25+叉头样转录因子3(forkhead box protein 3，Foxp3)+Treg占外周血淋巴细胞总数的7.50%(5.67%, 9.00%)，高于健康对照组的5.57%(5.03%，6.09%)，差异有统计学意义(U＝95.00, P＝0.010)。活动性肺结核未治疗组中，表达GARP的CD4+CD25+Foxp3+ Treg占CD4+CD25+Foxp3+ Treg总数的10.37%(7.79%，12.90%)，分别高于结核潜伏感染组的7.02%(5.15%，8.81%)和健康对照组的5.33%(4.26%，6.67%)，差异均有统计学意义(U＝31.00，P＝0.040；U＝36.00，P<0.001)；而结核潜伏感染组与健康对照组之间差异无统计学意义(U＝25.00，P＝0.095)。活动性肺结核未治疗组中，表达TGF-β1的CD4+CD25+Foxp3+ Treg占Treg总数的7.13%(4.25%，8.89%)，高于健康对照组的3.59%(2.10%，5.17%)，差异有统计学意义(U＝71.00，P＝0.001)。抗结核治疗<3个月组、治疗3～<6个月组、治疗≥6个月组活动性肺结核患者的CD4+CD8－CD25+Foxp3+Treg中GARP的表达量分别为7.82%(3.94%，13.17%)、6.92%(5.61%，9.47%)和7.26%(5.82%，9.64%)；3组中在CD4+CD8－CD25+Foxp3+Treg中TGF-β1表达量分别为11.16%(7.91%，15.23%)、8.66%(5.43%，12.54%)和7.82%(6.01%，9.53%)，其中治疗<3个月组TGF-β1的表达量高于治疗≥6个月组，差异有统计学意义(U＝37.50，P＝0.024)。结论Foxp3/GARP/TGF-β1通路可能参与Treg调控结核病发病的免疫机制，GARP有可能成为抗结核治疗的新型靶点。

简介：摘要目的联合应用基因组拷贝数测序(copy number variation sequencing，CNV-seq)和短串联重复序列(short tandem repeats，STR)技术分析染色体异常高危孕妇的流产原因和产前诊断方法。方法共收集36份样本，类型包括羊水、流产组织、全血、绒毛和脐带血。运用CNV-seq和STR分析，检测亚显微结构微缺失、微重复，染色体非整倍体性改变、染色体嵌合及三倍体。结果在完成检测的样本中，1份样本检出4p15.1p16.3和14q11.1q22.1重复，1份检出19p13.3缺失，8份检出染色体非整倍体，4份检出染色体嵌合，2份检出三倍体，20份样本未检出明确的致病性CNV，检出率为44.44%。结论CNV-seq作为一种高通量检测技术，具有快速、简便、准确率高等优点，与STR分析联合使用适用于产前诊断和流产因素分析。

简介：清代，古城北京有个酒楼叫“天然居”。“天然居”上有一幅以酒楼名字为题的对联：“客上天然居，居然天上客。”“僧游云隐寺．寺隐云游僧。”这种诗在文学体裁上称“回文诗”。即顺读、倒读都是一样的字句，读之自然，顺理成章，寓意深刻。

简介：数学与文学之间，时有惊人的相似之处。汉字是方块字，她有独一无二的特点：不但排列齐整，而且可以竖排，也能横排；可从左念，又可右读。因此，“回文”应运而生。

简介：目的：探讨癌性锚蛋白重复序列（gannankyrinrepeats，Gankyrin）在结直肠癌和正常黏膜组织的表达情况及与各临床病理因素之间的关系。方法通过免疫组织化学SP法对55例结直肠癌组织、30例癌旁黏膜组织检测Gankyrin蛋白的表达，检测所得的数据采用SPSS13．0统计软件包进行分析，各组资料的比较均采用卡方检验，以P＜0．05表示差异具有统计学意义。结果Gankyrin蛋白在结直肠癌组织中的阳性表达率为78．2％，在癌旁黏膜组织中的阳性表达率为23．3％，其癌组织的阳性表达率明显高于癌旁黏膜组织（χ2＝24．109，P＜0．01）；Gankyrin蛋白在同一结直肠癌患者的癌组织阳性表达高于癌旁黏膜组织的阳性表达（χ2＝6．722，P＜0．05）；在伴有淋巴结转移的组织中Gankyrin蛋白的阳性表达率明显高于无淋巴结转移的癌组织（χ2＝6．139，P＜0．05），在TNM分期中，（Ⅲ＋Ⅳ）期的癌组织Gankyrin蛋白的阳性表达率明显高于（Ⅰ＋Ⅱ）期阳性表达率（χ2＝5．130，P＜0．05）；Gankyrin蛋白在结直肠癌的阳性表达与年龄、性别、有无浆膜浸润和肿瘤的分化程度无显著关系（P＞0．05）。结论Gankyrin蛋白在结直肠癌组织中呈阳性表达，可能与肿瘤的发生发展有密切关系，对判断预后的意义有待进一步研究。

简介：无

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简介：摘要本文报告了1例通过促排卵后自然妊娠的孕妇，孕17周B超发现单胎妊娠，部分胎盘呈蜂窝样改变，孕期严密监测至孕38周剖宫产获得足月新生儿。综合临床表现，借助B超、生化检查、组织病理、免疫组化以及DNA短串联重复序列分子技术精确诊断，最终确诊为双胎之一完全性葡萄胎。随访4.5年，母儿均未见明显异常。

简介：结果以Mg2+2.0mmol/L、dNTP0.25mmol/L、引物0.3μmol/L、rTaq酶1U、模板1.5ng/μl、甲酰胺2%及退火温度（Tm-3）℃的ISSR反应体系最优,优化的ISSR-PCR反应体系对23份乌头种质DNA扩增结果（略）,因此反应体系中模板浓度确定为1.5ng/μl