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  • 简介:摘要规律间隔回文重复序列及其相关蛋白基因(CRISPR/Cas)系统,作为一种新兴基因编辑系统,根据Cas蛋白数量可分为一类系统和二类系统。二类系统中CRISPR/Cas9仅借助Cas9蛋白和单链向导RNA即可对目标核酸进行切割,是目前应用最为广泛CRISPR/Cas系统。除了基因编辑在遗传病治疗中应用,CRISPR/Cas系统衍生出多种技术在疾病相关基因筛查、基因表达调控、病原微生物快速检测和防治等领域也展现了巨大应用前景。本文就CRISPR/Cas系统发现历程及其衍生几个主要技术应用进行总结,旨在为生命科学领域研究人员提供参考。

  • 标签: 基因 成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白基因系统 基因编辑 衍生技术
  • 简介:摘要作为新一代基因编辑技术,规律间隔回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated proteins,CRISPR/Cas)系统具有强大基因编辑功能,已被应用于许多领域。目前,已开发规律间隔回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated protein, Cas)9、Cas12、Cas13和Cas14检测系统被广泛应用于传染病病原体核酸检测,具有检测成本低、操作简单、灵敏度高等优点。本研究介绍了CRISPR/Cas系统发展史、作用机制,以及几种Cas蛋白在传染病相关病原核酸检测中应用。

  • 标签: 规律成簇的间隔短回文重复序列 CRISPR相关蛋白质类 核酸检测 附带切割
  • 简介:摘要目的研究甘肃省鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)规律间隔回文重复序列(CRISPR)位点多态性及地区分布。方法选取1962-2014年分离203株鼠疫菌,培养并提取DNA。采用3对CRISPR引物对菌株DNA进行PCR扩增,对PCR产物进行测序。根据菌株CRISPR位点间区序列种类和排列情况,确定菌株基因型(类群),采用BioNumerics 5.10软件进行聚类分析。结果203株鼠疫菌发现有16种间区序列,包括YPa位点9种、YPb位点4种、YPc位点3种,发现新间区序列a1′。共发现5个CRISPR基因,分别为Cb2、Ca7、Ca7′、CaΔ5′、Ca35′。不同基因呈现区域性特征:Cb2主要分布在会宁县、平川区,Ca7主要分布阿克塞哈萨克族自治县;Ca7′主要分布在夏河县;Ca35′主要分布肃北蒙古族自治县、玉门市;CaΔ5′主要集中在肃南裕固族自治县。结论CRISPR分子分型方法能够较好地区分甘肃省不同疫源地菌株,且各基因呈现一定区域性特征。对研究甘肃省鼠疫菌进化规律和人间疫情分子生物学溯源有一定意义。

  • 标签: 鼠疫耶尔森菌 规律成簇的间隔短回文重复序列 基因型
  • 简介:摘要目的应用腺相关病毒(AAV)-规律间隔回文重复序列及其相关核酸酶9(CRISPR/Cas9)系统体外实验研究基因治疗威尔森氏症(WD)。方法选用2月龄雄性Toxic milk (TX)小鼠作WD模型,设计小向导RNA(sgRNA)并构建含有CRISPR元件AAV载体质粒命名为pAAV-sgRNA1、2、3,制备AAV,病毒滴度达1~4×1013 GC/ml;感染WD肝细胞,72 h后提取基因组DNA,聚合酶链反应(PCR)后测序检测基因编辑效率,筛选出其中活性最高者sgRNA1,构建相应同源修复模板(HT)质粒命名为pAAV-HT,应用AAV-sgRNA1和AAV-HT共感染WD肝细胞,测序和T7E1酶切检测模板修复效率;用HT特异性引物行PCR,验证HT掺入。组间比较采用Student’s t检验。结果Sanger测序结果显示,sgRNA1在体外有最高编辑效率[(20.2±2.3)%],与sgRNA2、3比较[(3.1±1.3)%、(14.6±2.0)%],差异有统计学意义(P<0.05)。进一步用HT进行基因修正,能检出特异性修正后ATP7B基因;二代测序测序显示修复率为(7.9±2.7)%。结论AAV-CRISPR系统在体外可以达到较高编辑效率和修复效率。

  • 标签: 威尔森氏症 基因治疗 腺相关病毒
  • 简介:摘要目的应用规律间隔回文重复序列及其相关核酸酶9系统(CRISPR/Cas9)体外实验研究修正威尔森氏症(WD)基因。方法选用来源于DL近交系小鼠Toxic milk小鼠(购自美国Jackson Laboratory公司)作WD模型,设计3个CRISPR来源RNA (crRNA)-crRNA001/002/003,应用CRISPR/Cas9核糖核蛋白复合物(RNP)方法转染WD肝细胞,48 h后提取基因组DNA,聚合酶链反应(PCR)后测序检测基因编辑效率,筛选出效率最高者crRNA001,并设计相应单链寡核苷酸(ssODN)修复模板;用crRNA001和ssODN共转染肝细胞,模板特异性引物行PCR,验证ssODN掺入。组间比较采用Student’S t检验。结果Sanger测序结果显示,crRNA001编辑效率为(57.8±5.1)%。用ssODN共转染细胞后,模板特异性引物行PCR,能扩增出修正后铜离子转运ATP酶β肽(ATP7B)基因条带;二代测序结果显示,ATP7B基因修复效率为(7.45±2.54)%。结论CRISPR/Cas9 RNP转染能达到较高编辑效率,相应ssODN可以高效修复缺陷ATP7B基因,为进一步体内实验提供理论和实验基础。

  • 标签: 威尔森氏症 成簇的规律间隔的短回文重复序列 基因治疗 铜离子转运ATP酶β肽 核糖核蛋白体
  • 简介:摘要病理诊断向来就是诊断疾病"金标准",正确病理诊断有助于临床治疗方案制定和预后判断。然而由于临床病理诊断工作非常繁杂,偶有不慎,可能会出现标本缺失、张冠李戴、蜡块内混入其他组织等病理技术上差错。法医物证中个体识别除了广泛用于灾难事故、交通事故和失踪人口身份认定、刑事案件中对犯罪嫌疑人同一认定外,还可以应用于医疗卫生领域,如医源性病理切片、蜡块同一认定,肿瘤组织来源的确认,造血干细胞移植前后供体与受体基因型比对等。该文就其中心鉴定3个案例做一分析,并谈谈如何利用串联重复序列(STR)分型图谱甄别正确组织病理标本。

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  • 简介:摘要癫痫发作是癫痫患者尤其是耐药性癫痫患者中常见临床现象,与患者平常发作频率、持续时间、发作类型等不同,其发作后精神障碍、癫痫持续状态和病死率较一般癫痫发作高,严重影响癫痫患者及护理人员生活质量。目前关于癫痫发作发病机制、诊断标准及治疗原则尚不明确。本文以“seizure cluster”“acute repitetive seizures”及“癫痫发作”作为关键词,检索“Pubmed”“万方医学”及“中国知网”数据库1990—2019年相关文献,对目前关于发作定义、患病率、危险因素、癫痫灶定位、潜在机制及目前治疗意见等做一综述,以期医护人员更清晰地认识及科学地处理成癫痫发作,降低癫痫发作患者癫痫持续状态及其他严重并发症发生率,提高患者及护理人员整体生活质量。

  • 标签: 成簇癫痫发作 急性反复性癫痫发作 癫痫持续状态 癫痫
  • 简介:作为一种新型分子标记,表达序列标签一简单重复序列(EST—SSR)来自表达基因,因此除具备来源于传统基因组SSR标记所有优势外,还与基因功能表达具有直接或间接关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中应用。我们简要介绍了EST-SSR标记开发策略、方法及其应用进展,总结了其中存在一些问题,目的是为今后该领域研究提供一定参考。

  • 标签: 表达序列标签 简单重复序列 标记开发 策略
  • 简介:摘要长链非编码核糖核酸(lncRNAs)在恶性肿瘤发生和发展调控中发挥重要作用,为多种肿瘤治疗研究中新靶点。常间回文重复序列丛集(CRISPR)/CRISPR关联蛋白系统(Cas)系统为新近发展高效精准基因组编辑工具。多项研究表明CRISPR/Cas系统可靶向lncRNAs,为肿瘤细胞lncRNAs表达调控提供了新策略。本文针对CRISPR/Cas技术调控lncRNA功能机制及其在恶性肿瘤研究中进展进行综述。

  • 标签: 长链非编码RNA 肿瘤
  • 简介:结果以Mg2+2.0mmol/L、dNTP0.25mmol/L、引物0.3μmol/L、rTaq酶1U、模板1.5ng/μl、甲酰胺2%及退火温度(Tm-3)℃ISSR反应体系最优,优化ISSR-PCR反应体系对23份乌头种质DNA扩增结果(略),因此反应体系中模板浓度确定为1.5ng/μl

  • 标签: 乌头简单 区间扩增 序列重复
  • 简介:<正>在文化发展过程中,艺术由综合形态逐步分化为文学、音乐、舞蹈、绘画、书法、雕刻、建筑等各种不同独立门类.这些不同艺术门类,它们在艺术整体中是杂乱地堆积在一起、任意厝身其间,还是存在着某种有规律秩序、构成一定序列关系、各有自己相应位置呢?这是一个颇为玄妙而又有趣美学问题.如果能找到这种序列关系,对于进一步认识各类艺术审美特征和它们相关性,是具有积极理论意义.

  • 标签: 艺术系统 精神观念 规律初探 精神层次 绘画 舞蹈动作
  • 简介:临床资料患者,女性,50岁。主因双眼眶周围及颧部皮损20余年,于2006年9月18日就诊我科。患者于20年前无明显诱因双颧部出现丘疹,丘疹初起较少,逐渐增多,

  • 标签: 粉刺 眶周 成簇性
  • 简介:摘要目的联合应用基因组拷贝数测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)和串联重复序列(short tandem repeats,STR)技术分析染色体异常高危孕妇流产原因和产前诊断方法。方法共收集36份样本,类型包括羊水、流产组织、全血、绒毛和脐带血。运用CNV-seq和STR分析,检测亚显微结构微缺失、微重复,染色体非整倍体性改变、染色体嵌合及三倍体。结果在完成检测样本中,1份样本检出4p15.1p16.3和14q11.1q22.1重复,1份检出19p13.3缺失,8份检出染色体非整倍体,4份检出染色体嵌合,2份检出三倍体,20份样本未检出明确致病性CNV,检出率为44.44%。结论CNV-seq作为一种高通量检测技术,具有快速、简便、准确率高等优点,与STR分析联合使用适用于产前诊断和流产因素分析。

  • 标签: 基因组拷贝数测序 短串联重复分析 产前诊断 拷贝数变异
  • 简介:清代,古城北京有个酒楼叫“天然居”。“天然居”上有一幅以酒楼名字为题对联:“客上天然居,居然天上客。”“僧游云隐寺.寺隐云游僧。”这种诗在文学体裁上称“回文诗”。即顺读、倒读都是一样字句,读之自然,顺理成章,寓意深刻。

  • 标签: 回文诗 回文数 文学体裁 寓意深刻 天然 酒楼
  • 简介:数学与文学之间,时有惊人相似之处。汉字是方块字,她有独一无二特点:不但排列齐整,而且可以竖排,也能横排;可从左念,又可右读。因此,“回文”应运而生。

  • 标签: 回文 数学 诗词 方块字 排列
  • 简介:《桂林山水》课文中有这样一句话:“这样山围绕着这样水,这样水倒映着这样山。”在这个句子中运用词语只有“围绕”和“倒映”两个是不同,其他部分都一样,只是词序回环往复了一下,可读起来却十分有趣。这是什么写法呢?

  • 标签: 回文 《桂林山水》 回环往复 课文 词序
  • 简介:摘要本文报告了1例通过促排卵后自然妊娠孕妇,孕17周B超发现单胎妊娠,部分胎盘呈蜂窝样改变,孕期严密监测至孕38周剖宫产获得足月新生儿。综合临床表现,借助B超、生化检查、组织病理、免疫组化以及DNA串联重复序列分子技术精确诊断,最终确诊为双胎之一完全性葡萄胎。随访4.5年,母儿均未见明显异常。

  • 标签: 妊娠并发症 葡萄胎 基因分型技术
  • 简介:摘要目的探讨早期妊娠两次药物流产安全间隔时间。方法对早期妊娠≤7周,选择再次药物流产终止妊娠同一患者,进行回顾性分析,两次妊娠药物流产间隔时间≤3个月者160例,间隔时间>3个月者380例,比较两组再次药物流产结局。结果两组完全流产率、不全流产率、失败率及流产后阴道流血量>100ml发生率比较,差异有统计学意义。结论早期妊娠再次药物流产安全间隔时间应大于3个月。

  • 标签: 早期妊娠 药物流产 间隔时间
  • 简介:汉语中回文我们可以信手拈来,诸如:客上天然居,居然天上客。上海自来水来自海上。雾锁山头山锁雾,天连水尾水连天。这三个句子正读与反读都是一样。事实上,在英文中也随处可见这样回文。按照构成元素不同,可以分为如下两种类型:字符型回文与单词型回文

  • 标签: 回文 英文 构成元素 自来水 汉语 句子