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  • 简介:摘要目的探讨MRI的不同影像组学模型预测术前脑胶质瘤O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动甲基化状态的效能。材料与方法回顾性分析经手术病理证实的114例大脑胶质瘤患者的MRI影像资料,包括T1WI、T2WI、ADC及T1WI增强序列。其中MGMT启动甲基化阳性58例,阴性56例,按8∶2比例分为训练组(91例)与验证组(23例),在T2WI及T1WI增强序列分别对肿瘤加水肿区及肿瘤核心区进行三维手工分割,提取总共688个影像组学特征,采用主成分分析进行特征降维,方差分析用于特征筛选,应用逻辑回归(Logistic regression,LR)算法、Lasso的逻辑回归算法(Logistic regression via Lasso,LR-Lasso)、支持向量机(support vector machine,SVM)、贝叶斯分类器(native Bayes,NB)构建诊断模型,5倍交叉验证方法用于训练模型,验证组数据用于评估模型的预测性能,ROC曲线用于计算模型的准确率、敏感度和特异度,ROC曲线下面积(area under curve,AUC)用于评估模型的预测性能。结果LR模型的AUC值、准确率为0.90和91%,敏感度和特异度为92%和91%,LR-Lasso模型的AUC值、准确率为0.80和74%,敏感度和特异度为67%和82%,SVM模型的AUC值、准确率为0.89和87%,敏感度和特异度为83%和91%,NB模型的AUC值、准确率为0.69和74%,敏感度和特异度为75%和72%。基于LR模型预测效能最高。结论MRI影像组学模型对预测术前脑胶质瘤MGMT启动甲基化的状态具有一定应用价值,4种模型预测效能中LR模型预测效能最高。

  • 标签: 胶质瘤 O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶启动子甲基化 影像组学 磁共振成像
  • 简介: 【摘要】目的 研究结肠癌患者血浆及粪便中APC基因启动甲基化检测及其临床意义。 方法 选择我院2021年1月-2023年1月期间收入的150 例健康查体者作为对照组,以及150例诊断明确的结直肠癌患者作为研究组,留取上述两组外周血和粪便,应用甲基化特异PCR(Methylation specific PCR,MSP)对上述标本进行APC基因启动DNA甲基化检测,判断各组标本启动的甲基化水平。 结果 150例结肠癌患者中,存在84例癌组织中检测到APC基因启动区存在甲基化改变,剩下66例未检测出APC基因启动区甲基化改变。150例结肠癌患者组织为阳性的患者中,有69例血浆中检测出阳性,阳性率达 46.00%;150例健康者的血浆中均没有检测到APC基因启动甲基化阳性,其特异性为100%。43例血浆APC基因启动甲基化阳性的肺癌患者其血浆甲基化APC浓度范围为1.61x102-6.98x102拷贝/mL,中位浓度为1.78x103拷贝/mL。 结论 MSP检测血浆APC基因甲基化在结肠癌诊断中具有一定潜在意义,对患者诊断具有一定帮助。

  • 标签: 结肠癌 血浆 粪便 APC 甲基化检测
  • 简介:摘要目的探讨错配修复基因1(hMLH1)启动甲基化状态与骨肉瘤患者临床病理和预后之间的关系。方法选取于2003年至2008年在中南大学湘雅二医院行手术治疗骨肉瘤患者46例,其中男33例,女13例,年龄(20.00±9.93)岁,根据Enneking分期分为Ⅰ期27例,Ⅱ期19例。提取骨肉瘤组织中的DNA,使用巢式甲基化特异性PCR(MSP)对hMLH1基因启动甲基化状态进行检测。采用χ2检验分析hMLH1基因启动甲基化状态与患者临床病理资料之间的关系;运用单因素分析Kaplan-Meier法对hMLH1基因启动甲基化状态与患者总体生存、无瘤生存的关系进行分析,并对得出的生存曲线进行对数秩和(Log-rank)检验。结果在24例5年内发生复发的患者中,有16例存在hMLH1基因启动的部分甲基化(66.67%);在22例5年内未发生复发的患者中,有4例存在hMLH1基因启动的部分甲基化(18.18%)。经χ2检验,hMLH1基因启动的甲基化状态与骨肉瘤患者的5年无瘤生存明显相关(χ2=25.956,P<0.01)。hMLH1基因启动甲基化状态与其他临床特征的相关性分析结果表明hMLH1基因启动甲基化状态与年龄(χ2=0.054,P>0.05)、性别(χ2=0.259,P>0.05)、Enneking分期(χ2=2.609,P>0.05)、肿瘤的病理类型(χ2=1.947,P>0.05)、病理分级(χ2=0.002,P>0.05)、5年总体生存(χ2=2.832,P>0.05)差异均无统计学意义。此外,通过对hMLH1基因启动的甲基化状态与总体生存进行单因素分析,结果表明相较于hMLH1基因启动甲基化组,非甲基化组患者的生存时间较长,但两组间差异无统计学意义(χ2=1.427,P>0.05)。对hMLH1基因启动的甲基化状态与无复发生存进行单因素分析的结果表明,相较甲基化组,hMLH1基因启动非甲基化组患者的复发可能性更小,且两组间差异有统计学意义(χ2=21.287,P<0.01)。结论hMLH1基因启动的甲基化状态与骨肉瘤患者的无瘤生存明显相关,与患者的总体生存无相关。

  • 标签: 骨肉瘤 错配修复基因1 甲基化 预后
  • 简介:摘要胶质瘤是颅内最常见的原发性恶性肿瘤,具有高度异质性,即使组织学分级相同,有时预后也具有显著差异,而基因分型则可以从本质上更好地阐述肿瘤的生物学行为,其中O6-甲基鸟嘌呤甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)与高级别脑胶质瘤(high-grade glioma,HGGs)的预后和治疗决策紧密相关。它是一种关键的DNA修复酶,不仅与脑胶质瘤的发生发展相关,还与烷化剂化疗的敏感性以及放疗反应相关。而MGMT启动甲基化会沉默MGMT的转录表达,是MGMT表达减少的重要机制。近年来随着科学技术的飞速进步,放射学也逐渐向人工智能的方向发展,本文对智能影像对高级别脑胶质瘤MGMT启动甲基化状态的预测性能进行了综述。

  • 标签: 高级别脑胶质瘤 O6-甲基鸟嘌呤甲基转移酶 磁共振成像 智能影像
  • 简介:摘要目的探讨GSDME启动甲基化通过细胞焦亡调控乳腺癌(breast cancer,BC)细胞化疗敏感性的机制。方法收集经过化疗治疗的54例BC患者组织,分为化疗耐受组与敏感组。使用多西他赛(docetaxel,DTX)处理BC细胞以建立耐药BC细胞。CCK8检测细胞耐药性。qRT-PCR检测组织与细胞中GSDME的表达。亚硫酸盐测序法检测GSDME启动甲基化位点的甲基化水平。干预DTX处理的BC细胞中的GSDME的表达水平,qRT-PCR检测细胞中Caspase-1、Caspase-4、IL-1β、IL-18水平,评估细胞焦亡程度。结果相对于化疗敏感组,GSDME在化疗耐受组中的表达下调(t=6.54, P<0.001)。与MCF-10A细胞相比,MCF-10A/DTX细胞中Caspase-1(t=9.14, P<0.001)、Caspase-4(t=9.35, P<0.001)、IL-1β(t=6.13, P=0.004)、IL-18(t=5.49, P=0.005)水平均下降,但在MCF-10A/DTX细胞中过表达GSDME后以上指标上调。GSDME启动区高甲基化导致mRNA表达降低(t=12.56, P<0.001),在耐受组织中GSDME启动区甲基化水平与mRNA水平呈负相关(r=-0.57, P=0.010)。使用甲基化抑制剂氮胞苷(5-azacytidine)处理MCF-10A/DTX细胞后,Caspase-1、Caspase-4、IL-1β、IL-18水平均显著提高,且GSDME水平上调。结论GSDME启动区高甲基化导致mRNA表达降低,抑制BC细胞焦亡,降低DTX化疗敏感性。

  • 标签: GSDME 甲基化 乳腺癌 细胞焦亡 多西他赛
  • 简介:摘要目的探讨使用MRI影像组学的方法,建立一个用于预测较低级别胶质瘤(lower grade gliomas, LGGs)异柠檬酸脱氢酶突变(isocitrate dehydrogenase mutation, IDH mut)合并氧6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶启动甲基化(O6-methylguanine-DNA methyltransferase promoter methylation, MGMT meth)亚型的影像组学模型。材料与方法回顾性分析来自山西医科大学第一医院、山西省人民医院和TCGA/TCIA(The Cancer Genome Atlas和The Cancer Imaging Archive)公共数据库的158例患者的术前MRI图像、临床和基因信息。将上述三处数据合并,对所有图像进行重采样和强度归一化处理后,以7∶3的比例随机分为训练集和测试集。从术前MRI图像上提取对比增强后T1加权序列(post-contrast enhanced T1-weighted, CE-T1)和T2加权流体衰减反转恢复序列(T2-weighted fluid attenuation inversion recovery, T2-FLAIR)的1702个影像组学特征。通过单因素逻辑回归(logistic regression, LR)、最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)进行有效特征筛选,使用合成少数过采样技术(synthetic minority over-sampling technique, SMOTE)对训练集少数类样本进行数据平衡。最后,使用多因素LR进行建模。通过受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线和校准曲线评价模型诊断效能和拟合优度,并建立列线图进行可视化风险预测。结果在训练集和测试集两个亚型的不同临床特征的组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。影像组学模型在训练集和测试集的AUC(area under the curve, AUC)分别为0.842和0.935,F-Measure分别为0.965和0.942,训练集校准曲线经Hosmer-Lemeshow检验的P值为0.1393。结论术前MRI影像组学模型可以预测LGGs患者IDH mut合并MGMT meth亚型,从而为LGGs患者的分子分型的精确诊断、替莫唑胺(temozolomide, TMZ)使用的决策、生存期预测提供重要的临床辅助价值。

  • 标签: 较低级别胶质瘤 影像组学 磁共振成像 异柠檬酸脱氢酶 氧6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶 分子分型
  • 简介:摘要目的通过检测端粒酶反转录酶(TERT)启动在放射性碘难治性甲状腺乳头状癌(RAIR-PTC)中的突变频率,探讨该基因突变对RAIR-PTC的摄碘特征及碘治疗疗效的影响。方法对2005年1月至2020年6月在江苏省原子医学研究所附属江原医院进行放射性碘治疗的RAIR-PTC[37例,其中男15例,女22例,年龄(49.8±16.1)岁]和碘治疗有效[40例,其中男13例,女27例,年龄(39.8±10.9)岁]PTC患者的TERT启动突变及B-Raf原癌基因丝/苏氨酸蛋白激酶(BRAF)V600E突变情况进行回顾性研究,分析不同基因突变类型的摄碘特征及碘治疗疗效差异。采用Fisher确切概率法及两独立样本t检验进行数据比较。结果RAIR-PTC中,TERT启动突变率为40.54%(15/37),高于碘治疗有效组(0,0/40;P<0.001),均为C228T位点突变,未发现C250T突变;而BRAFV600E突变率(64.86%,24/37)与碘治疗有效组(72.50%,29/40)比较差异无统计学意义(P=0.858)。TERT启动突变患者年龄更大(t=3.76,P=0.001),远处转移灶不摄碘率更高(P=0.037)。启动靶向治疗者及死亡病例中TERT启动突变患者分别占2/3和3/4。35例甲状腺球蛋白抗体(TgAb)阴性患者中,11/14的TERT启动突变者刺激性甲状腺球蛋白(sTg)升高,而无突变组该比例为57.1%(12/21),但差异无统计学意义(P=0.357)。结论RAIR-PTC患者中TERT启动突变率增高,临床工作中可将该基因突变作为预测碘难治的指标之一。

  • 标签: 甲状腺肿瘤 癌,乳头状 突变 转录启动子 端粒,末端转移酶 原癌基因蛋白质B-raf 近距离放射疗法 碘放射性同位素
  • 简介:摘要目的探讨4例ABO血型抗原表达减弱样本的分子生物学机制。方法采用微柱凝集法及盐水试管法进行ABO血型血清学检测,对ABO基因第1~7外显及其上游启动区域PCR产物直接测序进行ABO血型基因分型。结果4例样本(3例为患儿,1例为患儿的母亲)的红细胞与B抗体反应均出现混合视野(mf)现象,3例患儿表型为ABweak、例2母亲为Bweak。基因测序显示3例样本在ABO基因启动区域发生-35至-18位的碱基缺失,通过家系分析,提示该变异发生在B等位基因;1例样本ABO基因在启动区域发生-119位C>T新变异。结论启动区域序列发生变异可导致ABO血型抗原的表达减弱。

  • 标签: ABO血型 抗原减弱 基因测序 启动子区域碱基变异
  • 简介:摘要目的探讨谷胱甘肽转移酶mu5(GSTM5)启动区甲基化状态在骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展中的作用,为MDS的早期诊断提供新的潜在分子标记物。方法收集2018年10月至2021年6月在解放军总医院血液科初诊的40例MDS[MDS伴单系发育异常(MDS-SLD)5例,MDS伴多系发育异常(MDS-MLD)7例,MDS伴环形铁粒幼红细胞(MDS-RS)6例,MDS伴原始细胞增多Ⅰ型(RAEB1)13例,MDS伴原始细胞增多Ⅱ型(RAEB2)9例]患者、8例MDS转化为急性髓系白血病(sAML)患者和6例对照(4例缺铁性贫血、2例营养性巨幼细胞性贫血)患者的骨髓血标本。采用Agena MassARRAY核酸质谱技术对3组标本进行GSTM5基因启动区甲基化的定量检测。采用Wilcoxon非参数检验比较不同组GSTM5基因甲基化水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价试验的特异度、敏感度和准确度。结果聚类分析结果显示,MDS组GSTM5甲基化率高于对照组[0.50(0.27,0.79)比0.29(0.10,0.45),P<0.05];sAML组GSTM5甲基化率明显高于MDS组[0.67(0.36,0.86)比0.50(0.27,0.79),P<0.05]。分析各CpG位点甲基化率的差异,在CpG_1、CpG_4,5、CpG_6,7,8、CpG_11、CpG_13,14、CpG_15、CpG_16、CpG_22和CpG_24位点,MDS组与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,在CpG_6,7,8单位曲线下面积最大,AUC=0.861(95%CI 0.717~1.000,P<0.05),敏感度和特异度分别为85%和83%。分析GSTM5甲基化与MDS疾病发展的关系,在骨髓原始细胞较高组和高危亚组(RAEB)中GSTM5基因甲基化水平较高。结论GSTM5基因启动区甲基化在MDS中较常见,并且在MDS发生发展过程中可能起重要作用,可作为诊断MDS的潜在肿瘤标志物。

  • 标签: 骨髓增生异常综合征 甲基化 表观遗传学 GSTM5基因
  • 简介:摘要目的分析胰腺癌组织富含亮氨酸重复序列蛋白55(LRRC55)基因mRNA表达和启动区甲基化状态并探讨其临床意义。方法收集2019年5月至2021年5月间海军军医大学第一附属医院普外科37例行手术切除并经病理学证实的胰腺导管腺癌组织及其癌旁正常组织。另收集2例正常胰腺组织标本、2例健康成人外周血标本作为对照。记录患者的年龄、性别、肿瘤部位、肿瘤大小、分化程度、临床分期、是否淋巴结转移及血CEA、CA19-9水平。采用亚硫酸氢盐测序法(BSP)检测2例胰腺癌组织及癌旁组织、2例正常胰腺组织、2株胰腺癌细胞株(PaTu8988、ASPC1)LRRC55基因启动区CpG岛甲基化状态。应用实时定量PCR法检测35例胰腺癌及癌旁组织LRRC55基因mRNA的表达水平,并分析其与胰腺癌临床特征之间的关系。结果胰腺癌组织和胰腺癌细胞株LRRC55基因启动区CpG岛呈高甲基化状态,平均甲基化率分别为53%、71%,而癌旁组织和正常胰腺组织LRRC55基因为低甲基化状态,平均甲基化率分别为8%、11%;胰腺癌组织和对应癌旁胰腺组织LRRC55基因mRNA的相对表达量分别为0.21(0.02,1.00)、0.98(0.33,3.66),胰腺癌组织LRRC55基因mRNA表达量显著低于癌旁组织,差异有统计学意义(P=0.003)。相关性分析结果显示,胰腺癌组织LRRC55基因mRNA表达与肿瘤分化、CEA显著相关,而与患者年龄、性别、肿瘤部位及大小、CA19-9水平、有无淋巴结转移及临床分期均无相关性。结论胰腺癌组织及腺癌细胞株均存在LRRC55基因异常甲基化;LRRC55基因高甲基化与其基因表达降低有关,与胰腺癌组织的分化程度和CEA水平相关。该基因可能是胰腺癌的潜在抑癌基因。

  • 标签: 胰腺肿瘤 甲基化 富含亮氨酸重复序列蛋白55
  • 简介:摘要:随着科技的发展和人们的生活节奏的加快,大部分家居都实行的智能化来适应不断变快的生活节奏,当然,垃圾桶也不例外。加上“垃圾分类”政策的发布,为了让这一政策更快的融入到我们的生活当中,因此,本团队自主研发了一款自带垃圾识别的垃圾桶。该垃圾桶是基于单片机、触摸屏、语音模块、蓝牙控制系统的智能垃圾桶,区别于当下市场的智能垃圾桶,这款智能垃圾桶能够自主识别用户扔的垃圾并通过语音播报将识别的结果反馈给用户。在使用中学习垃圾分类,让垃圾分类融入我们的生活。

  • 标签: 垃圾分类 STM32单片机 智能化
  • 简介:摘要:垃圾分类习惯养成教育要结合幼儿实际,科学地开展教学实践,从而创新教学形式,进一步加强幼儿综合素质。教师开展研究幼儿园垃圾分类教育过程,要结合具体内容,有针对性地进行教学研究,从而激发幼儿兴趣,进一步培养幼儿良好习惯,以更好地为垃圾分类教育教学工作开展奠定基础。

  • 标签: 垃圾分类 幼儿园 养成教育 环保意识
  • 简介:【摘要】当前,垃圾问题已经成为一个污染环境困扰人类的大问题。这些垃圾如果不合理的区分和再利用将会污染土壤、水、空气等,如果进行合理的区分利用,将成为一种再生能源,是人了一笔可观的财富。幼儿园教育是学校教育的初始阶段,是幼儿习惯养成的关键期,如何开展垃圾分类教育,幼儿教育是启蒙教育环境保护,应从娃娃抓起,培养幼儿具有初步的环保意识和良好的环保道德行为,要求教师在教育教学中要注意环保内容的有机渗透,教育由浅入深的渗透环保知识,以及开展丰富多样的垃圾分类专题活动,让幼儿从小养成垃圾分类的好习惯,以及幼儿的自我服务意识,将是每个幼儿园必不可少的课题。

  • 标签: 幼儿园环保  垃圾分类  自我服务
  • 简介:摘要:《企业会计准则第22号——金融工具》将原四大类金融资产重新分为了三大类金融资产,并且三类金融资产中的债务工具相互之间可以重分类,涉及业务复杂,会计处理难度大。通过本文对金融资产重分类和金融资产重分类核算的研究供财会人员参考。

  • 标签: 金融资产 重分类 核算
  • 作者: 杨智尧
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  • 创建时间:2022-07-13
  • 出处:《家园.电力与科技》2021年14期
  • 机构:营口市滨海热电有限责任公司 
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