简介:目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者外周血中肺特异性X蛋白(LUNX)mRNA的表达及其临床意义。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT—PCR)方法检测56例NSCLC患者(实验组)及34例肺良性病变患者(对照组)外周血中LUNXmRNA的表达情况,分析其与临床病理组织学特征的关系。结果①实验组NSCLC患者外周血中LUNXmRNA阳性表达率为58.93%,而对照组无表达(P〈0.05)。②NSCLC患者外周血LUNXmRNA阳性表达率与肿瘤淋巴结转移、分化程度和临床分期有关(P〈0.05),而与患者年龄、性别、吸烟以及肿瘤部位、病理类型等均无关(P〉0.05)。结论外周血LUNXmRNA的检测可作为评价NSCLC发生、发展潜在指标,对判断病程和指导治疗具有重要的临床意义。
简介:AbstractBackground:Rectal cancer (RC) is a malignant tumor that seriously threatens human health. Long non-coding RNAs (lncRNAs) play a vital role in tumor regulation. Nevertheless, their exact expression features and functions remain obscure, and therefore was the aim of the current study.Methods:We utilized the Affymetrix human GeneChip to screen differentially expressed profiles of lncRNAs and mRNAs from the cancer tissues and matched paracancer tissues of 6 RC patients. Gene Ontology (GO) and pathway enrichment analyses identified crucial functions and pathways of the aberrantly expressed mRNAs. We used quantitative real-time polymerase chain reaction to verify the significant expression differences of 11 candidate lncRNAs between the cancer and paracancer tissues. LncRNA-mRNA coexpression networks were built by calculating the Pearson correlation value to identify significant correlation pairs. Online bioinformatics tools GEPIA2, ONCOMINE, and PROGgeneV2 were used to mine the expression and prognosis of three crucial mRNAs and six verified lncRNAs. Competing endogenous RNA networks were constructed by predicting microRNA response elements and calculating free energy.Results:We found 1658 differentially expressed lncRNAs (778 up-regulated and 880 down-regulated) and 1783 aberrantly expressed mRNAs (909 up-regulated and 874 down-regulated). GO and pathway enrichment analyses revealed the vital functions of the differentially expressed mRNAs, including cell proliferation, cell migration, angiogenesis, and cellular response to zinc ion. The canonical signaling pathways mainly included the interleukin-17, cell cycle, Wnt, and mineral absorption signaling pathways. Six lncRNAs including AC017002.2 (P= 0.039), cancer susceptibility 19 (CASC19) (P= 0.021), LINC00152 (P= 0.013), NONHSAT058834 (P= 0.007), NONHSAT007692 (P= 0.045), and ENST00000415991.1 (P= 0.045) showed significant differences in expression levels between the cancer tissue and paracancer tissue groups. AC017002.2, NONHSAT058834, NONHSAT007692, and ENST00000415991.1 have not yet been reported in RC. The crucial mRNAs myelocytomatosis viral oncogene (MYC), transforming growth factor beta induced (TGFBI), and solute carrier family 7 member 5 (SLC7A5) were selected. AC017002.2 and LINC00152 were positively correlated with MYC, TGFBI, and cytochrome P450 family 2 sub-family B member 6 (All r > 0.900, P < 0.050). NONHSAT058834 was positively associated with MYC (r = 0.930, P < 0.001), and CASC19 was positively correlated with SLC7A5 (r= 0.922, P < 0.001).Conclusion:This study offers convincing evidence of differentially expressed lncRNAs and mRNAs as potential biomarkers in RC.
简介:从铵孤立的RNA--并且对待硝酸盐的米饭叶子被用来屏蔽差别通过mRNA的表示基因微分显示。72个乐队的一个总数显得重要他们的差别和一些被反向的北、北的污点进一步证实。结果显示出那二基因,A-02(Oryzasativa干旱应力联系了mRNA)并且A-03(Zeamays为TFIIB相关的蛋白质的部分mRNA)在喂铵的米饭叶子是高度起来调整的。酶试金证明二抗氧化的酶,过氧化氢酶和peroxidase的活动,和一种non-enzymic抗氧化剂的内容,谷胱甘肽,比在喂硝酸盐的那些在喂铵的米饭叶子是显著地更高的,显示铵营养可能为米饭是有益的种在生长和开发期间改进压力抵抗。
简介:目的探讨胃癌患者外周血CD133mRNA表达情况及其临床意义.方法抽取10名健康志愿者(组1)、5例胃溃疡穿孔患者(组2),18例胃癌术前患者(组3)及19例胃癌术后患者(组4)外周静脉血2ml,分离单核细胞,采用半定量RT-PCR检测CD133mRNA表达水平.结果组3患者外周血CD133mRNA灰度值显著高于组1和组2(P=0.001).组4患者中12例复发转移者外周血CD133mRNA灰度值显著高于7例无复发转移者(P=0.042).CD133mRNA表达与淋巴结转移和肿瘤分期有关(P<0.05).CD133mRNA灰度值与淋巴结转移率呈正相关(P=0.007).结论胃癌患者外周血高表达CD133mRNA,其表达与淋巴结转移率正相关.胃癌术后外周血高表达CD133mRNA提示肿瘤复发或转移.
简介:摘要目的探讨可能影响mRNA疫苗粒径和粒径分布的因素。方法在不同离子强度缓冲液、pH值、稀释剂类型、稀释度和检测仪器条件下,采用动态光散射法对3批mRNA疫苗的粒径和粒径分布进行检测。结果稀释剂的离子强度增大时,疫苗的粒径随之增大,粒径分布不发生改变;稀释剂的pH值增加时,疫苗的粒径随之增大,当pH值达到弱碱性时,粒径分布出现明显变化;选择不同溶液作为稀释剂时,mRNA疫苗的粒径均不同,粒径分布无明显变化;疫苗稀释度≤100时,粒径和粒径分布均无明显改变;不同仪器参数下疫苗的粒径和粒径分布差异无统计学意义,但粒径分布略有不同。结论粒径和粒径分布受稀释剂、稀释度和检测仪器等因素影响,在生产与质控中应予以关注。
简介:目的在转录水平上检测人脑胶质瘤干细胞(BGSCs)中白介素-10(IL-10)的mRNA表达,探讨其在胶质瘤免疫及免疫治疗中的作用。方法从8例临床标本中培养出BGSCs,并通过生物学特性和免疫细胞化学方法予以鉴定。然后提取BGSCs以及相对应的原代脑胶质瘤细胞中的RNA进行实时逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测,测定IL-10的mRNA表达水平,并予统计学分析。结果成功从8例临床标本中培养出BGSCs并通过鉴定。定量检测mRNA表达显示,在BGSCs中IL-10的mRNA表达显著高于相应的原代培养的脑胶质瘤细胞,配对t检验显示P〈0.05,有统计学意义。结论首次检测了BGSCs中IL-10的mRNA表达水平,证实其高于相应的原代胶质瘤细胞。这可能是脑胶质瘤能逃避肿瘤免疫并且复发的原因,若要根治脑胶质瘤,应以BGSCs为靶点进行治疗。
简介:目的:观察变异链球菌在模拟微重力环境下形态学的变化,及对其葡糖基转移酶基因(gtfs)mRNA表达的影响。方法:采用旋转培养系统(rotarycellculturesystem,RCCS)建立模拟微重力细菌培养模型,将变异链球菌分为模拟微重力组和对照组。在37℃厌氧环境(80%N2,20%CO2)下培养24h,收集模拟微重力组及对照组菌体,通过扫描电镜、透射电镜观察细菌的形态学变化;并通过Q-PCR方法检测模拟微重力对变异链球菌gtfB,gtfC,gtfDmRNA表达的影响。结果:扫描电镜图片显示,模拟微重力组细菌之间的不定形胶冻样物质明显少于对照组;透射电镜观察显示模拟微重力组细菌的荚膜部分减少,分裂状态下的细菌两极不对称。模拟微重力条件下变异链球菌gtfB、gtfC、gtfDmRNA表达水平呈下降趋势,与对照组之间差异均有统计学意义(P〈0.01)。结论:模拟微重力环境下变异链球菌的超微结构有显著改变,对其gtfB、gtfC、gtfDmRNA表达有明显的抑制作用。
简介:目的:研究板层蛋白在肾小球疾病时质或量的改变,探讨它们在肾脏中的生理功能和病理学意义。方法:本研究以板蛋白α1,α2,β1,β2,γ结构链为观察对象,用免疫组织化学和原位杂交技术研究他们在48例肾小球疾病病理肾人组织的表达和分布是否发生质或量的改变。结果:LNα1,α2,β1和γ的mRNA在伴系膜增生的肾小球内表达有不同程度的增加,增生的系膜细胞是主要的细胞来源,在肾小球系膜增殖节段和硬化病灶附近伴有LNα1和γ1的蛋白增多和α2,β1蛋白的异常表达,而LNβ2链在相应节段的系膜区和GBM表达出现不同程度的下降。结论:在系膜增生的肾小球疾病中,增生的系膜细胞是肾小内板层蛋白量的积聚和异常合成的重要细胞来源,在肾小球疾病中,板层蛋白的合成出现量和质的变化,这可能是肾小球疾病进展和恶化的物质基础。
简介:目的观察钠氢交换体1(sodium—hydrogenexchanger1,NHE1)在心力衰竭患者心肌组织中的表达,探讨NHE1在心衰发生和发展中的作用。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ—PCR)检测35例心力衰竭患者心肌组织NHE1mRNA的表达水平。结果实时荧光定量PCR(FQ—PCR)检测心功能Ⅰ级组、心功能Ⅱ级组、心功能Ⅲ级组心力衰竭患者心肌组织NHE1mRNA的△Ct值分别为6.29±0.66、5.01±0.60、4.40±0.74。与心功能Ⅰ级组比较,在心功能Ⅱ级组、心功能Ⅲ级组患者心肌组织中NHE1mRNA表达明显高于心功能Ⅰ级组(P〈0.01),同时与心功能Ⅱ级组比较,心功能Ⅲ级组患者心肌组织中NHE1mRNA水平增高,且差异有统计学意义(P〈0.05)。结论心衰患者心肌组织中存在NHE1mRNA的高水平表达,提示NHE1可能在心衰的发生和发展过程中起着重要作用。
简介:摘要目的研究增殖期与消退期婴儿血管瘤(IH)长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA的差异表达情况。方法2019年1-3月在四川大学华西医院小儿外科收集行手术切除治疗的8例IH组织(增殖期与消退期各4例),运用基因芯片技术筛选差异表达(P < 0.05,差异倍数≥ 1.5)lncRNA和mRNA,并用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对芯片结果进行验证。同时,应用生物信息学方法,对差异基因进行GO功能和KEGG通路分析,并构建lncRNA-mRNA共表达网络,预测差异lncRNA的顺式作用靶基因。结果通过基因芯片技术共筛选出405条差异lncRNA(108条下调,297条上调)与772条差异mRNA(107条下调,665条上调)。qRT-PCR验证4条lncRNA(n335248、ENST00000450864、n333319和n335185)与4条mRNA(EDNRA、IFI6、HK2与ITGA1)的表达,结果与基因芯片检测结果一致。GO与KEGG富集分析发现,差异mRNA主要参与血管凝固、轴突导向、血管生成和细胞黏附等生物过程,差异mRNA主要富集在代谢通路、细胞局部黏附、肌动蛋白细胞骨架调控、白细胞跨内皮迁移、磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶等信号通路。lncRNA-mRNA共表达网络由度值≥ 15的23条mRNA和58条lncRNA共同构建组成。结论增殖期与消退期IH组织中存在大量差异表达的lncRNA和mRNA,这些lncRNA可能通过调控相应的靶mRNA参与IH发生发展。
简介:目的探讨肾癌相关蛋白CAIX/MN/G250mRNA在肾细胞癌(renalcellcarcinoma,RCC)手术前后的表达水平及临床意义。方法应用RT—PCR技术检测57例RCC患者癌组织及术前外周血中CAIX/MN/G250mRNA的表达情况,并选择15例癌旁肾组织、15例正常肾组织及40例健康人外周血作对照,对术前外周血CAIX/MN/G250mRNA阳性RCC患者术后随访4周,并对其外周血CAIX/MN/G250mRNA水平进行半定量检测。结果57例RCC患者,其CAIX/MN/G250mRNA阳性率在外周血中为59.6%(34/57),癌组织中为78.9%(45/57),显著高于对照组(P〈0.01)。在肾透明细胞癌患者的外周血及癌组织中,CAIX/MN/G250mRNA的阳性率分别为76.2%(32/42)和95.2%(40/42),均显著高于相应对照组(P〈0.01)。RCC患者外周血及癌组织中CAIX/MN/G250mRNA阳性率均随临床分期的增加而增加(P〈0.01)。34例外周血阳性患者CAIX/MN/G250mRNA水平术前2h、术后7、14、21和28d分别为0.54±0.13、0.56±0.15、0.34±0.13、0.29±0.18和0.22±0.11。RCC患者外周血CAIX/MN/G250mRNA水平在肾癌根治术后随时间的推移呈下降趋势(P均〈0.05)。结论使用RT—PCR技术检测CAIX/MN/G250mRNA对肾癌尤其是透明细胞癌有较好的特异性和敏感性。外周血CAIX/MN/G250mRNA检测可作为肾癌微转移的检测指标用于RCC的诊断、疗效评价及预后判断。
简介:通过观察结肠的mucosal为ulcerative大肠炎(UC)探索划分植物的艾灸的机制组织病理学说的变化和原子因素kappaB(NF-B)和peroxisome的表示UC老鼠的激活proliferators的受体(PPAR)mRNA。
简介:摘 要 : 使用原位杂交的方法检测 137例乳腺癌组织中 EphA2以及 EphrinA mRNA的表达情况。原位杂交检测, 129例浸润性导管 癌组织中 EphA2阳性表达率为 73%, EphrinAl的为 80%; 8例导管内癌中 EphA2阳性表达率为 37%, EphrinAl的为 50%; EphA2和 EphrinAl的 mRNA表达均与年龄和 TNM分期无关 (P> 0.05),而与病理分型、癌组织大小、淋巴结转移、组织学类型等有关系 (P< 0.05)。 EphA2与 EphrinAl在乳腺癌组织中呈高表达,这可能在乳腺癌的研究中起重要作用。