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  • 简介:摘要目的利用多重荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)分析急性下呼吸道感染患儿4种病毒:人腺病毒(HADV)、人博卡病毒(HBoV)、人偏肺病毒(HMPV)、人呼吸道合胞病毒(HRSV)的感染情况。方法收集1 045例急性呼吸道感染的住院患儿鼻咽深部分泌物标本,采用多重荧光RT-PCR进行呼吸道病毒4项指标检测,就病毒分布情况、季节因素等方面进行临床流行病学特点分析。结果1 045例患儿中有281例4种呼吸道病毒阳性,总阳性率为26.89%;其中单一病毒感染194例(69.04%)、混合病毒感染87例(30.96%),HMPV感染最多,为120例(42.70%)、其次为HRSV感染119例(42.35%);在各年龄组中≤3岁组阳性229例(36.06%),4~7岁组阳性114例(42.22%),≥8岁组阳性63例(45.00%)。从季节分布来看,春、夏、秋、冬四季的检出率分别为25.68%、28.24%、49.34%、65.57%。结论多重荧光RT-PCR法能快速检测乌鲁木齐地区儿童急性呼吸道病毒,呼吸道病毒感染主要为HMPV和HRSV感染;呼吸道病毒患儿感染率最高年龄段为≥8岁;以秋季和冬季为呼吸道病毒感染高发期。

  • 标签: 呼吸道感染 呼吸道合胞病毒 流感病毒 博卡病毒 偏肺病毒
  • 简介:目的:对比分析酶联免疫吸附试验(ELISA)法和实时荧光定量PCRRT-PCR)法在麻疹病毒检测中的应用。方法:由本市各医院采集并送至本中心接受麻疹病毒检测的50例疑似麻疹患者为研究对象,所有患者标本均采用ELISA法和RT-PCR法进行麻疹病毒检测。对比两种检测方式在不同出疹时间段所取标本的阳性率、检测水平。结果:在50例疑似麻疹患者中,ELISA法检测麻疹病毒IgM抗体阳性22例,IgM抗体阴性28例,阳性率为44.00%;RT-PCR检测,麻疹病毒IgM抗体阳性26例,IgM抗体阴性24例,阳性率为52.00%,两种检测方式阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。患者出疹第1天收集的标本,采用ELISA法检测阳性率为60.00%,采用RT-PCR检测阳性率为80.00%。随着患者采样时间不断改变,两种检测方式的阳性率均逐渐降低,两种方法检测的阳性率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。50例麻疹疑似患者同一时间段采集血清和咽拭子标本,24例患有免疫史,不伴随有免疫史亦或者是不详的共26例。结论:RT-PCR法适用于出疹时间在2d之内疑似麻疹患者的临床诊断中,而ELISA法则适合使用在出疹时间在2d或以上疑似麻疹患者的临床检测中。

  • 标签: 酶联免疫吸附试验法 实时荧光定量PCR法 麻疹病毒
  • 简介:TA克隆构建含MOC1基因cDNA片段的重组质粒,作为TaqMan定量检测水稻分蘖基因MOC1mRNA的标准品,建立了检测方法。采用RTPCR。的方法,从水稻分蘖芽总RNA中逆转录扩增总cDNA,PCR扩增MOC1基因中设计的目的片段,将纯化的目的片段与pMD19-TSimple载体连接,转化宿主菌JM-109,提取重组质粒DNA,PCR鉴定并测序分析。纯化质粒并检测260nm吸光值,确定重组质粒原液的拷贝浓度并以此制备荧光定量PCR梯度浓度标准品。对重组质粒进行实时荧光定量PCR实验。建立了MOC1基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法,特异性好,检测灵敏度达10^2拷贝,线性范围为10^2-10^7拷贝,阈值循环数与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系(r=0.999),扩增效率高(E=92.8%)。成功建立了MOCI基因实时荧光PCR定量标准品,且TaqMan荧光定量RTPCR的方法可对水稻分蘖基因MOC1mRNA的表达进行准确定量。

  • 标签: 水稻 分蘖 基因表达 实时定量RT—PCR TAQMAN探针
  • 简介:摘要目的建立可以检测阿瓦朗病毒(Avalon virus,AVAV)和休斯病毒(Hughes virus,HUGV)两种内罗病毒的实时荧光定量RT-PCR检测方法,并进行初步的评价。方法收集、整理、比对、分析在公共数据库发布的两种病毒基因组核苷酸序列,确定检测靶标,设计特异性引物、探针,优化检测程序,建立实时荧光定量RT-PCR检测方法。利用体外转录技术制备的模拟样本、其他病毒感染标本、病毒株和正常人血标本比较评价所建方法的检测限、特异性、重复性特征。结果所建实时荧光定量RT-PCR检测方法可有效扩增检测AVAV和HUGA靶标RNA,检测限分别约为20拷贝/μl和70拷贝/μl,检测科萨努尔森林病毒、乙型流感病毒BV和BY型、甲型流感病毒H3N2、黄热病毒、乙型脑炎病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、发热伴血小板减少综合征、内罗毕羊病毒和塔西那病毒样本无非特异性扩增,两种内罗病毒相互间无交叉反应,重复性比较分析显示变异系数小于2%。结论本研究建立的检测AVAV和HUGV的实时荧光定量RT-PCR方法,可用于临床样本检测和媒介生物、宿主动物标本筛查,便于病原的快速识别和疾病诊断。

  • 标签: 内罗病毒 实时荧光RT-PCR 阿瓦朗病毒 休斯病毒
  • 简介:Abstract:TheP24antigentest,HIVRNAPCRtest,HIVisolation/cultureandfourth-generationHIVuniformAg/AbassayarebeingutilizedindiagnosingacuteHIVinfectionindifferentlabs.ManyfactorslimittheuseofscreeningforacuteHIVinhigh-riskpopulations,inblooddonorsandduringvoluntaryHIVtesting,including,cost,technique,sensitivityandspecificity.InthisreviewweexploreanewNAATmethodwhichinvolvesHIVRNART-PCRonpooledsamples.Thistechniqueisabletoscreenforacuteinfectionsinalargetestingvolumeandmayheusedasascreeningmethodinhigh-riskpopulationsandblooddonors.

  • 标签: 公用池 RNA RT-PCR化验 诊断 急性HIV传染病 灵敏性
  • 简介:[ 摘要 ] 目的: 分析儿童肺泡灌洗液 RT-PCR 检测对支原体感染的辅助诊断价值。 方法: 选取我院儿科收治感染肺炎支原体的患儿进行研究分析。 结果: 研究可知, MP-lgM 阳性率和 MP-DNA 阳性率明指标对比具有差异则表示实验有价值, P 〈 0.05 具有统计学意义。 结论: 为支原体感染肺炎患儿采用 RT-PCR 进行肺泡灌洗液 MP-DNA 拷贝量监测,能够快速为患儿进行确诊,评估患者的病情状况,为患者的治疗提供依据。

  • 标签: 儿童肺泡灌洗液 RT-PCR监测 支原体感染 辅助诊断
  • 简介:摘要目的了解宁波市儿童呼吸道感染病原体的流行特征,为临床防控和诊治提供参考依据。方法收集2019年7~10月份间宁波市妇女儿童医院就诊急性呼吸道感染患儿的标本共3 103例,通过基于毛细电泳的多重RT-PCR检测常见的13种呼吸道病原体,并对结果进行统计分析。结果3 103例患儿中2 053例呼吸道病原体检测阳性,总阳性率为66.16%。检出率前3位分别为肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae, Mp)33.19%(1 030/3 103)、鼻病毒(human rhinovirus, HRV)24.20%(751/3 103)和腺病毒(human adenovirus, HADV)8.77%(272/3 103)。病原体在男性患儿和女性患儿中的检出率分别为65.70%(1 157/1 761)和66.77%(896/1 342),差异无统计学意义(χ2=0.386, P=0.535);在年龄≤1岁组、1~≤3岁组、3~≤6岁组和6~≤16岁组检出率分别为58.02%(626/1 079)、74.37%(589/792)、73.78%(543/736)和59.48%(295/496),组间差异具有统计学意义(χ2=84.770, P=0.000);7~10月份检出率依次为71.64%(341/476)、68.81%(536/779)、67.01%(648/967)和59.93%(528/881),差异具有统计学意义(χ2=24.395, P=0.000);单一感染率为52.30%(1 623/3 103),2种及以上病原体混合感染率为13.86%(430/3 103),其中以2种病原体混合感染多见。结论宁波市儿童呼吸道病原体检出以Mp和HRV为主,病原体检出率在不同年龄阶段和不同月份间存在一定差异。

  • 标签: 儿童 呼吸道病原体 多重RT-PCR法
  • 简介:摘 要:在此次疫情传播过程中,由于气溶胶颗粒可悬浮于空气中,并随空气流动扩散,因此气溶胶传播途径被世卫组织认为是造成大面积病毒传播的主要原因。封闭空间内空气流通较弱,携带有病毒颗粒的气溶胶可以更长时间悬浮于空气中,从而易导致更高的病毒感染率。本文讨论了气溶胶采样技术及现有PCR技术的发展水平,分析了开展病毒高效快速的检测与监控的现实可能性,解决如何在疑似高危险感染区域和人员密集场所(如医院、车站、商场)空气中及早发现潜在的传染源的现实需求。

  • 标签: 病毒气溶胶 环境检测 公共卫生 基础设施
  • 简介:【摘要】 目的 探讨实时荧光定量PCR( RT-PCR)法与抗酸涂片染色法在支气管肺泡灌洗液中查结核分枝杆菌,辅助诊断肺结核的作用。方法 回顾性分析2022年1月至2023年12月在大理市第一人民医院住院的疑似肺结核患者279例,采用集菌涂片法、PCR实时荧光探针法同时检测病人肺泡灌洗液标本,对检测结果进行分析和比较。比较两种方法在肺泡灌洗液标本中检测结核分枝杆菌的准确率、敏感性及特异性。结果 RT-PCR检测肺结核患者肺泡灌洗液结核分枝杆菌的检出准确率、敏感性和特异性均高于抗酸涂片染色法(P<0.05)。结论 RT-PCR检测肺泡灌洗液标本中的MTB,具有快速、诊断准确率、灵敏度和特异性较高的优点,可提高肺泡灌洗液标本中MTB的检出率并能减少误诊和漏诊的发生。

  • 标签:    PCR荧光探针法 TB 肺泡灌洗液 灵敏度 特异性
  • 简介:Objective:ToestablishafluoregenicprobequantitativeRT-PCR(FQ-RT-PCR)methodfordetectionoftheexpressionofMDR1geneintumorcellsandtoinvestigatetheexpressionofMDR1geneinpatientswithlungcancer.Methods:ThefluorogenicquantitativeRT-PCRmethodfordetectionoftheexpressionofMDR1genewasestablished.K562/ADMandK562celllinesor45tumortissuesfrompatientswithlungcancerwereexaminedonPEAppliedBiosystems7700SequenceDetectionmachine.Results:theaveragelevelsofMDR1geneexpressioninK562/ADMcellsandK562cellswere(6.86±0.65)×107copies/mgRNAand(8.49±0.67)×105copies/mgRNA,respectively.Theformerwas80.8timesgreaterthanthelatter.Eachsamplewasmeasured10timesandthecoefficientvariation(CV)was9.5%and7.9%,respectively.VariouslevelsofMDR1geneexpressionweredetectedin12of45patientswithlungcancer.Conclusion:QuantitativedetectionofMDR1geneexpressionintumorcellswasachievedbyusingFQ-RT-PCR.FQ-RT-PCRisanaccurate,andsensitivemethodandeasytoperform.Usingthismethod,lowlevelsofMDR1geneexpressioncouldbedetectedin24%ofthepatientswithlungcancer.

  • 标签: Fluorogenic 量的 RT-PCR/MDR1 Expression/Real 时间 察觉
  • 简介:【摘要】目的:分析新型冠状病毒抗原检测胶体金法与核酸检测实时荧光RT-PCR方法比较。方法:选取新冠阳性和新冠阴性的咽拭子各100份,时间为2022年11月-2022年12月。分别采用胶体金法和RT-PCR检测。对比两种方法的检测结果。结果:核酸检测阳性的100例样本中,胶体金法检出阳性99例、阴性1例;核酸检测阴性的100例样本中,胶体金法检出阳性0例、阴性100例。以核酸检测结果为金标准,胶体金法抗原检测阳性符合率为99.00%、阴性符合率为100.00%、总符合率为99.50%。结论:在新型冠状病毒检测过程中,可采取抗原检测胶体金法,能够达到较高的准确率。

  • 标签: 新型冠状病毒 抗原检测 胶体金法 核酸检测 实时荧光RT-PCR法
  • 简介:摘要目的建立针对发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)、登革病毒(dengue virus, DENV)、汉滩病毒(hantaan virus,HTNV)三种常见病毒性出血热病毒的现场应急快速检测方法。方法基于传统的TaqMan荧光探针技术,利用国产快速一步法RT-PCR试剂盒,结合magnetic induction cycler (Mic) qPCR仪,建立三种常见病毒性出血热病毒的快速荧光定量RT-PCR检测方法。利用三种病毒体外转录RNA及模拟样本、其他相关病毒临床样本及健康人血标本进行灵敏度、特异性、重复性验证。结果相较于传统的实时荧光定量RT-PCR方法,此方法所需时间大大缩短,可在35 min内完成检测。SFTSV、DENV、HTNV的最低检出限均小于100拷贝/PCR,与模拟对照样本及其他病毒临床样本无交叉反应,模拟阳性样本验证均可检出,且各组验证结果的Ct值变异系数均小于4%。结论本研究建立的快速荧光定量RT-PCR检测方法具有良好的灵敏性、特异性和重复性。对于现场应急检测和媒介生物标本筛查具有一定的应用前景。

  • 标签: 发热伴血小板减少综合征病毒 登革病毒 汉滩病毒 快速荧光定量RT-PCR
  • 简介:根据GenBank上发表的猪流行性腹泻(PEDV)和猪传染性胃肠炎(TGEV)基因序列,针对其PEDVM(膜蛋白)基因保守区及TGEV的S基因(纤突蛋白基因)5端保守区,各设计一对引物,可特异扩增出目的条带大小分别为467bp和1062bp。用上述两对引物

  • 标签: 中的冠状病毒 例猪粪 应用方法
  • 简介:摘要目的通过对我院529例婴幼儿(RT-PCR检测结果进行分析,了解广州市番禺区手足口病的流行状况,为手足口病预防和控制提供实验依据。方法收集2012年529例疑似手足口病症状的婴幼儿咽拭子标本,采用(RT-PCR)对手足口病病毒RNA,EV71,EV,CA16进行定性检测。应用卡方检验对不同年龄段婴幼儿CA16,EV71,其他EV结果进行比较。结果在529例患者咽拭子中,305例检测结果阳性,总阳性率为57.66%,其中EV71阳性88例,占总阳性率的28.85%,CoxA16阳性50例,占总阳性率的16.39%,其它肠道病毒阳性为167例,占总阳性率的54.75%。结论2012年广州市番禺区手足口病原以其他型肠道病毒感染为主。

  • 标签: 手足口病 RT-PCR 婴幼儿 肠道病毒
  • 简介:目的建立一种检测丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白基因的巢式RT-PCR方法,以及HCV核心蛋白基因区测序分型方法。方法从国际HCV数据库查找HCV核心蛋白基因序列,设计HCVRNA巢式RT-PCR引物及测序引物,并建立巢式RT-PCR反应体系。采用出入境人员抗-HCV阳性血清60份,及50份标本为HCV抗体检测阴性,且谷丙转氨酶(ALT)〉100U/L的血清进行巢式RT-PCR检测,阳性结果使用本研究建立的测序引物进行基因测序以确定HCV基因型。结果60份抗-HCV阳性血清中,42份(70.0%)核心蛋白基因RT-PCR扩增阳性,其中1b型27例、1a型12例、6a型1例、3a型1例、2a型1例。50份ALT〉100U/LR抗-HCV阴性标本中,1份HCV核心蛋白基因RT-PCR扩增阳性,测序鉴定为3a型。结论本研究建立了一种HCVRNA核心蛋白基因的巢式RT-PCR检测和分型方法,为出入境人员HCV的诊断和监测提供重要依据。

  • 标签: 丙型肝炎病毒 核心蛋白基因 巢式RT-PCR 基因分型
  • 简介:摘要目的对咸阳市首例甲型H1N1流感病例进行病毒核酸检测,为此后疫情的防控提供参考;方法采集病人1份咽拭子标本,使用两种不同厂家试剂,利用实时荧光RT-PCR检测1进行甲型H1N1流感病毒核酸检测;结果结果显示两种试剂RT-PCR反应体系扩增曲线都有明显对数增长,且Ct值符合质量控制的标准,为甲型H1N1流感病毒核酸阳性,同一份咽拭子标本送陕西省疾控中心复检,结果为甲型H1N1流感病毒核酸检测为阳性;结论这名病人为1例甲型H1N1流感病毒感染者的密切接触者,由于及时采用灵敏度高,特异性强,检测时间短的实时荧光定量RT-PCR方法检测,快速确诊了病例,为疫情的控制争取了时间,防止了2代病例的出现。

  • 标签: 甲型流感 实时荧光RT-PCR 检测