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  • 简介:摘要目的探讨采用蛋白组学技术筛选不同中医证型胃癌相关蛋白的应用效果。方法选取本院收治的胃癌患者32例,依据不同中医证型分为实证组17例与虚证组15例,分别对两组患者血清进行蛋白提取与分离,采用蛋白组学技术筛选其相关蛋白,并分析蛋白组学技术在中医证型中的应用价值。结果不同中医证型患者的血清蛋白双向电泳图表现具有明显差异,虚证患者的血清电泳检测出(1408±14)个蛋白位点,实证患者血清电泳检测出(1407±12)个蛋白位点,且焦磷酸酶1、犯醌蛋白1、谷胱甘肽S转移酶与热休克蛋白90β在虚证患者中的表达显著强于实证患者。结论采用蛋白组学技术对胃癌患者其中医辨证分型具有良好的指导作用,对临床中医治疗具有确切价值。

  • 标签: 胃癌 中医证型 蛋白质组学技术
  • 简介:通过比较脑肿瘤患者和正常人脑脊液的二维凝胶电泳图谱(two-dimensionalelectrophoresis,2DE),并对差异蛋白进行质谱鉴定,以寻找肿瘤特异脑脊液蛋白.以脑肿瘤患者和正常人的脑脊液为研究对象,采用固相pH梯度(immobilizedpHgradient,IPG)2DE分离总蛋白,凝胶经银染显后,用ImageMaster2D图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白.结果得到肿瘤患者脑脊液蛋白点924个,正常脑组织蛋白点607个,匹配512个,匹配率分别为55.4%和84.3%,去冗余后发现,有35个蛋白点只在脑肿瘤患者脑脊液图谱中出现.肿瘤患者脑脊液和正常对照脑脊液双向电泳图谱有明显差别,但是本实验尚未对这些差异蛋白进行质谱鉴定,所以未找出肿瘤特异蛋白.

  • 标签: 脑肿瘤 蛋白质组 蛋白质组学 双向电泳 脑脊液
  • 简介:摘要目的建立燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个微小RNA(microRNA,miRNA)靶基因的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选具有重要作用的基因及基因模块。方法将本课题组前期筛选的燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA(hsa-miRNA-3131、hsa-miRNA-4516、hsa-miRNA-6501-5p、hsa-miRNA-10b-5p、hsa-miRNA-4683)的靶基因定位到STRING在线数据库(https://string-db.org),筛选PPI网络。使用Cytoscape v3.6.0软件对PPI网络可视化,通过NetworkAnalyzer插件得到拓扑属性值度和拓扑属性值介数,筛选PPI网络的中心节点(度和介数均最高的节点)。同时,采用CytoHubba插件中的最大团中心(MCC)分析方法来确定PPI网络中的重要节点。通过MCODE插件进行聚类分析,筛选PPI网络的基因模块。将基因模块所包含的蛋白名称在线提交KOBAS v3.0数据库(http://kobas.cbi.pku.edu.cn/),对MCODE插件筛选出的基因模块进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果靶基因的PPI网络由1 035个节点和4 346个边组成。泛素蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)的度(101)和介数(0.010 723 89)均最高,为PPI网络的中心节点。经MCC分析,UBA52为PPI网络中的重要节点。从PPI网络中选择排名前5的基因模块,5个基因模块的KEGG通路富集分析中高度富集的基因通路分别为泛素介导的蛋白水解、剪接体、内吞作用、神经活性配体-受体相互作用、囊泡转运。结论成功建立了燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA靶基因的PPI网络,筛选出UBA52基因和5个基因模块主要通路。

  • 标签: 微小RNA 蛋白质-蛋白质相互作用网络 KEGG
  • 简介:目的研究江西口岸出入境人员HIV-1艾滋病感染者免疫试验(WB)带型的分布特征。方法对2003—2013年3月江西口岸出入境人员HIV-1抗体确证阳性的WB带型结果进行统计分析。结果23例江西口岸出入境人员HIV-1阳性标本免疫带型中gp160、gp120、p66、p51、gp41、p31、p24阳性率为100%,p55阳性率为78.3%,p17阳性率为95.6%;中国籍和非洲籍人员比较,非洲籍人员的p55阳性率高于中国籍人员;不同性别比较,p55阳性率差别有统计学意义,女性高于男性;不同年龄组间比较,p55阳性率差异有统计学意义。结论江西口岸出入境人员HIV—1抗体阳性者gp160、gp120、p66、p51、gp41、p31、p24阳性率高,具备确证HIV-1的特异性条带,对于不同国家的出入境人员还有待进一步扩大样本量进一步研究。

  • 标签: HIV-1抗体 免疫印迹实验 出入境人员
  • 简介:紫花苜蓿为多年生豆科草本植物,伊朗在有历史记载之前的很长时间里就已种植,因此被认为是苜蓿的起源中心。如今,苜蓿是世界土种植面积最大的豆科牧草,种植面积达八千万英亩。苜蓿营养成分齐全而均衡,适应性强、分布范围广、产量高,是一种重要的饲料作物,同时它还可以控制土壤侵蚀,改善水的质量,保护生态平衡,而且为后续作物提供大量的氮,因而事有“牧草之王”的美誉。苜蓿的粗蛋白含量高,品质好是优于其它牧草的显著特征之一,本文就苜蓿蛋白的特征和近年来关于影响苜蓿粗蛋白含量的因素的研究成果作一综述。

  • 标签: 粗蛋白含量 紫花苜蓿 蛋白质 豆科牧草 种植面积 饲料作物
  • 简介:目的评价牛乳腺生物反应器表达的重组人乳蛋白乳粉蛋白的营养价值。方法选用100只清洁级刚断乳(出生后20-23d)SD大鼠(雌、雄各半),按性别、体质量随机分为5组:重组人乳蛋白乳粉组、普通乳粉组、酪蛋白乳粉组、牛乳铁蛋白乳粉组、重组人乳铁蛋白乳粉组,分别喂饲相应饲料28d,观察大鼠的进食量、体质量,测定血常规、血生化情况,试验末期处死动物,称量脏器重量并对脏器进行病理学检查,计算蛋白功效比和校正蛋白功效比,对氨基酸评分。结果重组人乳铁蛋白乳粉雄性动物组总体蛋白功效比值差异有统计学意义(P〈0.05),但重组人乳铁蛋白乳粉组雄性和其他对照组差异无统计学意义(P〉0.05)。雌性动物重组人乳铁蛋白乳粉组和其他对照组蛋白功效比值差异无统计学意义(P〉0.05)。结论重组人乳铁蛋白乳粉的蛋白功效和其他组相比并无较大区别,氨基酸评分结果显示苯丙氨酸和酪氨酸为第一限制氨基酸,与普通乳粉一样。

  • 标签: 重组人乳铁蛋白 重组 人乳铁蛋白 乳粉 蛋白质 功效评价
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  • 简介:尽管胰腺癌影像学诊断水平明显提高,但是早期患者往往缺乏临床症状而没有进行影像学检查。目前常用的肿瘤标志物CA19-9在胰腺癌的筛查中敏感性和特异性不高,尤其对于早期胰腺癌诊断价值不大,所以胰腺癌的早期诊断仍然是个难题。随着分子生物学技术迅猛发展,蛋白组学应运而生。本文应用SELDI—TOF—MS技术探测胰腺癌患者血清蛋白组学的变化,以期发现特异的蛋白类肿瘤标志物,从而实现胰腺癌的早期诊断。

  • 标签: 血清蛋白质组学 早期胰腺癌 诊断水平 指纹谱 分子生物学技术 影像学检查
  • 简介:摘要病理性心脏重塑是多种心脏疾病的主要病理改变,表现为心肌肥厚和纤维化,并最终导致心力衰竭。心肌细胞作为一种终末分化细胞,增殖再生能力有限,因此蛋白稳态对于心肌细胞生存和功能极其重要。细胞蛋白稳态是指蛋白的合成与降解过程达到动态平衡,其主要受到包括分子伴侣、泛素蛋白酶体、细胞自噬等3种途径在内的蛋白质量控制系统的调节。近年的研究表明,心肌细胞蛋白稳态在心脏稳态维持中发挥重要作用,蛋白质量控制系统中任一环节出现异常均可能引起蛋白毒性,从而导致病理性心脏重塑。该文综述了蛋白稳态在心脏稳态维持中作用的新进展,并展望了通过调节蛋白稳态治疗心脏疾病的前景。

  • 标签: 心脏重塑 蛋白质稳态
  • 简介:蛋白一级结构鉴定实验中将传统蛋白酶解技术联用质谱技术是当前蛋白研究所必需,通过探索和实践,使本科教学渗入科研第一线,激发学生的科研兴趣。

  • 标签: 蛋白质酶解 实验教学 改革
  • 简介:由双向电泳、质谱、计算机图像数据处理组成的蛋白组学的技术体系具有高通量、高分辨率和高重复性的特点,能对微量样品进行全面自动定量分析.并在药物作用靶标、安全性评价、耐药性机制、疾病动物模型研制和中医药现代化等方面有新颖而重要的应用。蛋白组学技术将在药物研究和开发中带来根本性的变革,我国应尽快将蛋白组技术用于药物研究中。

  • 标签: 蛋白质组学技术 新药研究 药物研究 临床应用 双向电泳 质谱
  • 简介:本文对聚乙二醇修饰蛋白多肽类药物的原理、意义、方法及应用等方面进行综述。

  • 标签: 蛋白质多肽类药物 PEG修饰
  • 简介:蛋白和糖类物质是影响DNA纯度的重要因素。以不同辣椒种质茎尖叶片为材料,测定蛋白和糖类物质含量。试验结果表明,材料LX4茎尖叶片蛋白含量最高,为21.32mg/g(FW),热辣4号蛋白含量最低,为10.15mg/g(FW);热辣4号茎尖叶片含糖量最高,为2.25%,L515含糖量最低,为0.82%;不同辣椒材料间茎尖叶片中的蛋白和糖类物质含量存在不同程度的差异。本研究为选择有效方法提取高纯度、高质量辣椒基因组DNA提供了参考。

  • 标签: 辣椒 含糖量 蛋白质含量
  • 简介:摘要背景TKI目前已广泛用于EGFR突变型非小细胞肺癌肺癌患者。肿瘤样本可利用性和肿瘤本身的一致性仍是医生选择目标人群的难点。本研究通过使用MALDI-TOF质谱技术分析NSCLC患者服用TKI治疗前后血清蛋白变化,旨在探讨可能用于预测TKI治疗后出现耐药的血清多肽。方法收集49例晚期NSCLC患者接受TKI治疗前后自身配对的血清样本98份,即服用TKI治疗前及疗效评价为进展后所采集的外周血血清。所有入选患者共分为2组good组PFS>6个月;poor组PFS≤1个月。所有的患者对TKI治疗的最佳总疗效为疾病稳定或部分缓解。所有样本用弱阳离子微珠进行预分离后,在BrukerAutoflexTM基质辅助激光解析离子化-时间飞行质谱仪(MALDI-TOF-MS)上进行血清蛋白谱检测。以ClinProTools(Version2.1)软件进行数据采集分析。结果分析整体49例样本治疗前后组自身配对差异多肽,两组数据用统计学软件得出有统计学意义(p<0.01)的差异多肽峰16个。在good组的24例样本中,治疗前后组自身配对聚类分析得出两组数据交叉确认值94.44%,区别率95.45%均为最高。两组数据用统计学软件得出有统计学意义(p<0.01)的差异多肽峰20个。Poor组的25例样本治疗前后组自身配对聚类分析得出两组数据交差验证值68.10%,识别率87.87%。后使用统计学软件未找到两组m/z在1,000Da-10,000Da范围内表达的有统计学意义的差异多肽峰。结论本研究发现在PFS>6个月的good组中,治疗前后血清蛋白谱峰信号强度变化有统计学显著差异。在20个有明显统计学意义(p<0.01)的多肽峰,其代表的蛋白分子很可能与NSCLC患者产生TKI耐药或疾病进展相关。而PFS≤1个月的poor组,治疗前后血清蛋白谱峰信号强度变化并无统计学差异。但鉴于本研究的病例数有限,需要进一步扩大样本量验证并检测分析并探索这些差异蛋白的具体名称及具体的分子机制。

  • 标签: 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 非小细胞肺癌 表皮生长因子-酪氨酸激酶抑制剂
  • 简介:牙周组织包括牙周膜、牙骨质、牙槽骨和牙龈,为牙齿及周围组织提供附着支持、本体神经感受和修复保护等功能。在感染、创伤或接受外界刺激时,牙周组织会发生适应性改建.不同类型的细胞发生定向迁移、增殖分化及功能活化,并与细胞外基质相互作用,维持牙周改建的动态平衡。

  • 标签: 牙周组织 蛋白质组学 应用 适应性改建 细胞外基质 周围组织
  • 简介:蛋白、总氮的检测虽有不同的分析方法,但都涉及到样品消化与蒸馏过程。现以使用蛋白测定仪进行消化、蒸馏这两个过程中的注意事项与同行交流。

  • 标签: 蛋白质测定仪 检测过程 蒸馏过程 样品消化
  • 作者:
  • 学科: 医药卫生 > 免疫学
  • 创建时间:2015-01-11
  • 出处:《医药前沿》 2015年第1期
  • 机构:由上海生物信息技术研究中心主办,上海生咨生物科技有限公司承办有多组学实验及数据分析系列小型研习会将在2015月1月15日-16举办首场“蛋白质组学和代谢组学”研习会。本次学习内容由上海生物信息技术研究中心的科研人员主讲,内容分为两块:1)蛋白质组学:常用实验方法介绍、样本处理注意事项、数据分析方法;2)代谢组学:实验设计及样本处理、代谢组学数据处理。本次研习会适合需要用到蛋白质组学、代谢组学进行研究的科研人员和临床医生,将帮助与会人员了解当前蛋白质组学和代谢学组的研究方法,开拓实验设计的思路。
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