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  • 简介:摘要目的了解中国乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因组序列的免疫逃逸突变、耐药突变和基因组进化信息。方法选取1998-2021年在GenBank中的中国HBV全基因组序列信息作为分析对象,采用MAFFT软件进行聚类分析,使用在线工具Gen2pheno进行免疫逃逸突变和耐药突变分析,使用BEAST 1.10.4做序列的时间进化分析。结果5 426条序列纳入分析集,分布于我国19个省份,C型占比最高(59.1%,3 211/5 426)。其次为B型(33.7%,1 833/5 426)。有764条(14.1%,764/5 426)序列发生了免疫逃逸突变,98.1%的序列至少发生了1处反转录酶编码区域突变。中国大部分系列的进化根在公元1801年左右。结论中国HBV耐药突变率较高,HBV基因组进化缓慢。

  • 标签: 乙型肝炎 基因组耐药和免疫逃逸突变 基因组进化
  • 简介:摘要目的了解2019年河南省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)的型别及分布情况。方法2019年河南省共报告AFP病例513例,每例病例采集双份粪便标本进行病毒分离,对NPEV阳性毒株进行VP1基因扩增和测序鉴定,序列的比对以及遗传进化树的构建通过MEGA5.1软件完成。使用Excel 2016和SPSS19软件对NPEV阳性毒株的流行病学数据进行统计分析。结果从513例AFP病例中共分离出39株NPEV,分离率为7.60%(39/513),其中18株为A组病毒,21株为B组病毒,A组和B组病毒均包含7个血清型,未分离到C组和D组病毒。A组中以柯萨奇A组病毒(coxsackievirus A,CVA)4型和CVA16为主,B组中以埃可病毒(echovirus,Echo)11型为主。NPEV阳性毒株之间的核苷酸一致性为67.4%~100.0%,与原型毒株核苷酸一致性为71.4%~85.6%。NPEV主要集中在7岁以下的散居儿童当中,分离率为84.62%(33/39),男女性别比为2.07∶1,分离率在不同年龄组之间以及不同性别之间均无统计学差异(P>0.05)。A组病毒中CVA2、CVA4和CVA16分布比较广泛,B组病毒中Echo3、Echo11和Echo30分布比较广泛。时间上除1月份以外,全年均能分离出NPEV,其中A组病毒主要发生在4~7月,分离数占到全年的66.67%(12/18),B组病毒主要发生在9月,分离数占到全年的28.57%(6/21)。结论2019年河南省分离的NPEV以B组Echo11为主要血清型,病原谱、地区分布以及不同年龄NPEV的分离率相比2018年发生了明显的变化。因此要加强监测,有针对性的进行防控,有效减少AFP的发生。

  • 标签: 急性弛缓性麻痹 非脊髓灰质炎肠道病毒 分子鉴定 流行病学特征
  • 简介:摘要目的探究2021年河南省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)的型别及流行特征。方法收集2021年河南省报告的529例AFP病例的粪便标本,对其进行病毒分离,其中NPEV阳性毒株进行VP1区域序列测定,使用MEGA5.1软件对序列进行比对并构建遗传进化树。使用Excel2016和SPSS26软件对流行病学数据进行整理和统计学分析。结果529例AFP病例粪便标本共分离出30株NPEV,分离率为5.67%(30/529),其中A组和B组病毒各分离出15株,未分离出C组和D组病毒。A组包含6个血清型,以柯萨奇病毒A组(coxsackievirus A,CVA)2型和CVA6为主,B组包含3个血清型,以柯萨奇病毒B组(coxsackievirus B,CVB)3型为主。人群分布中,5岁以内的儿童NPEV的分离率最高,为76.67%(23/30),男女比例为1.51∶1。地区分布中,A组病毒主要分布在河南省的中部、南部和西南部,以CVA2和CVA4分布最为广泛,B组病毒相对比较集中,主要分布在河南省的中部、北部和西南部,以CVB3为主。时间分布上全年除1~2月以外均能分离出NPEV,整体呈现春夏季高发,秋冬季低发的流行特征,其中A组病毒高峰期在5月份,B组病毒高峰期在6~7月。结论2021年河南省分离的NPEV以B组CVB3为主要血清型,NPEV的病原谱以及地区分布相比2018—2019年发生了显著变化,后期应当密切关注当前NPEV的流行趋势,为AFP的诊断、监测以及维持河南省无脊髓灰质炎的状态提供理论依据。

  • 标签: 急性弛缓性麻痹 非脊髓灰质炎肠道病毒 柯萨奇病毒B组3型 分子鉴定