利用ISSR分子标记技术对不同生态类型的39份龙眼种质进行亲缘关系分析。研究结果表明，从100条ISSR引物中筛选出12条重复性好、条带清晰的引物，对39份龙眼种质基因组DNA进行扩增，得到152个位点，其中多态性位点117个，多态性比例为76．97％。供试龙眼种质间遗传相似系数变幅为0．57～0．92，说明ISSR标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。UPGMA聚类结果表明，在0．65相似水平可以将39份龙眼种质分为3个类群，类群I均为来自中国的南亚热带生态型龙眼；类群Ⅱ包括石硖和大鸟圆2个南亚热带生态型龙眼品种，以及热带生态型龙眼四季蜜类型的品种和单株；类群Ⅲ包括来自越南和泰国的龙眼种质。不同生态类型对龙眼的亲缘关系影响不大，热带生态型和南亚热带生态型龙眼相互聚在一起，说明两种不同生态类型龙眼具有较多相同的遗传背景。本试验结果将有助于进一步开展龙眼的分类、遗传与进化研究。
