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  • 简介:选用60个结构多样HCV复制抑制剂分子作为数据集,随机选择其中46个分子作为训练集,剩余14个分子作为验证集.采用多元线性回归(MLR)和主成分分析(PCA)方法对每个分子646个理化和结构参数进行了线性回归分析,并分别建立各自最优模型.结果表明MLR中逐步和向前法所建模型最佳,模型结果为:训练集R2=0.827,验证集R2=0.850,模型能够直观地反映影响化合物活性主要因素.该模型将有助于筛选和开发新HCV复制抑制.

  • 标签: HCV复制抑制剂 定量构效关系 多元线性回归 主成分分析
  • 简介:采用密度泛函方法,以键解离焓(EBD)和电离势(EIP)为理论指标评价了硫辛酸清除自由基活性,发现硫辛酸EBD和EIP均小于具有抗氧化活性VC、VE和没食子酸.结合优势构象几何构型、电荷分布和前线轨道布居分析结果,发现二硫五元环是分子中活性区域,电荷密度较大,可以与金属离子螯合;S—S键较长,且EBD和EIP均较小,可以形成自由基而发挥抗氧化作用.羧基部分可以调节分子水溶性,且电荷密度较大,也可以和金属离子螯合.初步明确了硫辛酸"结构-抗氧化性"关系.

  • 标签: 硫辛酸 抗氧化性 密度泛函 理论研究
  • 简介:探讨了氨基酸结构与RNA中碱基三字密码间关系,找到了与决定氨基酸相应碱基三字码主要因素,指出决定氨基酸三字码第1,2个码碱基亲水性要与氨基酸亲水性相匹配,强亲水性碱基与强亲水性氨基酸相应;第2个码碱基亲水性是决定其亲水性主要因素,而第1个码碱基亲水必屯有相当影响,每种氨基酸碱基三字码个数多少,以及三字码中第3个码为何种碱基,都与氨基酸化学结构密切相关,特别是与R(R

  • 标签: 遗传密码 RNA 氨基酸 结构 碱基
  • 简介:研究了68个TR(ThyroidHormoneReceptor,甲状腺激素受体)配体化合物化学结构与活性定量构效关系.采用实验室新近提出三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关系模型.复相关系数和交互检验复相关系数R^2=0.767,Q^2=0.625(TRα),R^2=0.734,Q^2=0.61(TRβ).模型具有良好稳定性和预测能力,证明了该三维原子场全息相互作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上适用性,并可应用于潜在和新型TR配体化合物设计和开发.

  • 标签: 三维原子场全患相互作用矢量(3D—HoVAIF) 甲状腺激素受体(TR)配体 定量构效关系(QSAR)
  • 简介:IrganoxHP-136是瑞士Ciba公司开发一种含有内酯结构苯并呋哺酮类抗氧剂,能有效捕获碳自由基,起到很好抗氧作用。尽管专利报道有大量不同结构苯并呋喃酮类抗氧剂被合成,但因受Ciba公司产品供应结构限制,目前有关苯并呋哺酮类抗氧剂工业化应用产品仅限于由HP-136与不同受阻酚以及亚磷酸酯类抗氧剂复配得到复配型抗氧剂,

  • 标签: 苯并呋喃 抗氧剂 稳定化作用 结构 酮类 加工
  • 简介:应用半经验量子化学AM1方法得到了24种三苯基丙烯腈衍生物优势构象,利用AM1方法和分子图形学技术获得其电子结构、几何结构及拓扑结构参数,并将这些参数与三苯基丙烯腈衍生物对乳腺癌细胞(MCF-7)生物活性相关联.结果表明,三苯基丙烯腈衍生物对MCF-7活性与羟基指示数、分子表面积和B环上原子净电荷之和之间存在良好的多元线性相关性,成功地建立了三苯基丙烯腈衍生物构效关系式.

  • 标签: 三苯基丙烯腈衍生物 定量构效关系 羟基指标 分子表面积 药物研究 乳腺癌
  • 简介:对TATB及其系列衍生物进行了半经验分子轨道PM3和AM1计算,求得全优化几何构型和电子结构.结果发现各化合物分子中C-NO2键Wiberg键级(WCN)均小于其他C-N或C-C键键级.实验撞击感度h50%与WCN计算结果之间分别呈三阶或二阶多项式关系,相关系数r≥0.92.当WCN<0.90时,该值对撞击感度影响甚微,表明属高感度炸药;而当WCN>0.90时,撞击感度与分子中最小C-NO2键级WCN呈显著线性关系,WCN增大,撞击感度线性递减,符合判别感度相对大小"最小键级原理".

  • 标签: TATB 衍生物 撞击感度 C—NO2键级 1 3 5-三氨基-2 4 6三硝基苯 AM1
  • 简介:用量子化学密度泛函理论(DFT)、分子力学(MM)及模式识别方法,对34个新型均三氮苯类衍生物进行了结构活性关系研究.结果表明,影响此类衍生物分子除草活性主要因素有C(1)上所带电荷Qc(1),分子总能量E,分子生成热Ef,溶剂可及面积SGrid,分子体积V和C(3)上所带电荷Qc(3)等参数.通过在C(1)上加上吸电子基,降低C(1)上电荷,以及在C(3)上连接单取代氨基可以提高除草活性.所得模型对化合物生物活性有较好预测效果.

  • 标签: 量子化学 密度泛函理论 构效关系 模式识别
  • 简介:建立糖原合成激酶-3β(GSK-3β)抑制剂三维构效关系,可预测新糖原合成激酶-3β抑制剂.通过确定分子药效构象,与选定模板分子进行叠合,采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)分别建立38个糖原合成激酶-3β抑制剂3D-QSAR模型.比较分子力场分析法所建立模型决定系数q2=0.711,非交叉验证系数r2=0.887,标准偏差ES=0.411,显著系数F=109.856;比较分子相似性指数分析法所建立模型决定系数q2=0.605,非交叉验证系数r2=0.931,标准偏差ES=0.326,显著系数F=122.122.该模型在一定程度上反映了结合部位性质要求,解释马来酰胺类抑制剂构效关系,具有较好预测能力.

  • 标签: 糖原合成激酶-3β抑制剂 三维定量构效关系 比较分子力场分析法 比较分子相似性指数分析法
  • 简介:应用AM1法几何全优化计算获得47个靛红衍生物电子结构、几何结构和分子性质各种参数,然后采用多元线性回归方法,构建化合物对急性单核组织细胞淋巴瘤细胞U937体外抗肿瘤活性预测模型.模型复相关系数(R。)、留一法(LOO)交互检验复相关系数(Rcv2)和均方根误差分别为0.851,0.825和0.347,用预测集样本进行了外部预测,所得外部预测集交互检验系数Qext^2为0.725,表明所建QSAR模型具有较好稳健性和较强预测能力,模型外推有效.模型结果表明:疏水参数logP越大,ELUMO越负,化合物抗肿瘤活性越大.对模型应用域(AD)进行了表征,所建模型可以应用于应用域内靛红衍生物对U937抑制活性预测,具有潜在应用价值.

  • 标签: 靛红衍生物 U937 AM1 定量构效关系 应用域
  • 简介:采用密度泛函理论B3LYP方法计算了13个13位取代苦参碱衍生物电子结构,研究了化合物结构与抑制人肝癌细胞HepG2抗癌活性定量构效关系(QSAR).结果表明:(1)13位取代苦参碱类衍生物最低空轨道能ELUMO越低,最低空轨道与最高占据轨道能隙ΔE越小,化合物抗癌活性越高;(2)分子能量Etotal、面积S以及体积V越大,其极化度P越大,活性越大;(3)分子油水分配系数logP越大,活性越大,即分子疏水性增大活性增强.综合得到了显著性较好QSAR方程:-lgIC50=97.008-11.759ΔE+818.602QC2-2.132×10-4Etotal,可用于预测该类衍生物抑制人肝癌细胞HepG2活性并进行分子设计.

  • 标签: 苦参碱 抗癌活性 密度泛函理论 定量构效关系(QSAR)
  • 简介:在模拟人体生理条件下,采用紫外光谱法、荧光光谱法、DNA热变性及黏度法研究欧前胡素及同分异构体异欧前胡素与DNA作用机制,并探讨其构效关系.紫外光谱表明,加入DNA后,欧前胡素和异欧前胡素紫外光谱均呈现减色效应;荧光光谱显示,随着欧前胡素或异欧前胡素浓度增大,DNA—BR荧光被猝灭,表明欧前胡素和异欧前胡素对BR与DNA结合存在竞争性抑制;盐效应、DNA热变性温度、黏度法等实验进一步证明欧前胡素和异欧前胡素与DNA作用模式均为嵌插与静电混合作用模式.研究表明,欧前胡素和异欧前胡素均与DNA发生作用,且欧前胡素与DNA作用强于异欧前胡素.

  • 标签: 欧前胡素 异欧前胡素 小牛胸腺DNA 紫外光谱法 荧光光谱法 黏度法
  • 简介:利用Gaussian03计算软件包,在DFT-B3LYP/3-21G水平上对ZSM-5分子筛128T簇模型进行了研究.通过分析T—O—T基团键角、桥羟基键长、质子电荷和分子轨道能隙等数据,讨论了ZSM-5分子筛硅铝比与其Brnsted酸性关系,预测了其催化性能.计算结果表明,ZSM-5分子筛硅铝比越低,酸性越强,相应催化性能越好,与实验结果相符.

  • 标签: ZSM-5分子筛 硅铝比 簇模型 密度泛函理论 Brφnsted酸性 催化性能
  • 简介:利用荧光光谱、紫外吸收光谱并结合分子模拟技术对3种分子结构相似,仅母核上C环3位取代功能团不同黄酮小分子槲皮素、金丝桃苷及芦丁对蛋白质构象影响进行了对比研究.探讨黄酮分子相同位置上功能团不同对相互作用体系结合常数、结合位点数、结合作用力及蛋白质构象影响.实验表明黄酮母核C环3位上单糖苷存在抑制了其药效发挥,而单糖苷递增为双糖苷时这种抑制作用会有所减弱.

  • 标签: 分子模拟 光谱法 槲皮素 金丝桃苷 芦丁 蛋白质
  • 简介:用溶剂热法合成了基于环糊精金属有机骨架化合物(Na-CD-MOF),采用X-射线单晶衍射、红外光谱和元素分析进行了结构表征.以5-氟尿嘧啶(5-FU)为模型药物,研究了Na-CD-MOF细胞毒性和载药及体外释药能力.研究结果表明,新合成Na-CD-MOF对5-FU负载量最大为1.18g/g,且具有明显缓释作用.体外细胞毒性实验表明,Na-CD-MOF具有良好生物相容性,有望成为一种绿色药物载体.

  • 标签: 金属有机骨架 环糊精 5-氟尿嘧啶 载药量 药物缓释
  • 简介:讨论并比较了由2,6-二叔丁基苯酚、甲醛和均三甲苯合成1,3,5-三甲基-2,4,6-三(3,5-二叔丁基-4-羟基苄基)苯(抗氧剂330)各种合成方法及反应机理,并介绍了抗氧剂330基本性质。

  • 标签: 抗氧剂 均三甲苯 苯酚
  • 简介:利用C-O键上C原子电荷Qc和分子所含C原子个数Ⅳ作为醇分子结构描述符对其沸点巩、在水中溶解度Sw及辛醇/水分配系数(k)进行了QSPR研究.Qc计算采用Chemoffice8.0中MOPAC-AM1量子化学法,容易获取,它表征了醇分子同分异构体之间结构差异.多元回归分析结果表明醇分子Tb,-lgSw,lgKow都随分子所含C原子数Ⅳ增加而增加,随着C-O键上C原子电荷Qc增大而减小,复相关系数均在0.99以上.MOPAC-AM1方法计算量化参数Qc用于与脂肪醇水溶解性关联优于分子连接性指数.

  • 标签: 量子化学参数 AM1 定量结构性质关系 辛醇/水分配系数
  • 简介:给怀孕10d小鼠胃灌流视黄酸(100mgRA/kg体重)6和24h后,对视黄酸合成酶基因Raldh2和代谢酶基因Cyp26a1,Cyp26b1在胚胎肢体表达进行了分析.Cyp26a1和Cyp26b1在灌流6h,表达增加;灌流24h,表达恢复到正常水平.Raldh2在此时间段表达降低.这些结果提示:在小鼠早期胚胎肢体发育中,存在视黄酸诱导视黄酸代谢.

  • 标签: 视黄酸 肢体发育 视黄酸合成 视黄酸代谢
  • 简介:简单介绍了世界采样大会由来与PierreGy采样理论产生与发展。重点阐述了PierreGy公式和采样理论涵义与应用,以及化学计量学对采样理论发展推动和促进作用。同时,采样理论发展也推动了过程分析技术应用以及各类先进采样、制样和混样设备研制和应用。中国作为全球最大大宗商品进口国和消费国,对采样理论和实践应用有着迫切需求,将第九届世界采样与混样大会引入中国,必将促进和提升我国采样理论研究和实践水平,使其更好地为我国大宗商品交易和检验检测市场服务。

  • 标签: 世界采样与混样大会 PIERRE Gy采样理论 化学计量学 过程分析技术 采制样设备
  • 简介:用简单可行方法合成了功能化石墨烯(GNSPF6)和磁铁掺杂还原氧化石墨烯(RGO-Fe3O4),并进一步研究了pH值、接触时间和温度对它们吸附亚甲基蓝(MB)影响.结果表明,随着pH值和温度增加其吸附量也随之变大,从而说明该吸附过程是自发吸热.因为GNSPF6吸附过程只用了不到20min时间,所以它吸附是高效.用经典准一级反应、准二级反应和粒内扩散模型对其吸附过程进行动态分析,从结果可以发现,准二级动力学模型比准一级动力学模型更适用于描述吸附过程.采用传统Langmuir,Freundlich和L-F吸附等温线模型来模拟分析数据,在20℃时,由Langmuir吸附等温线模型模拟分析得知GNSPF6和RGO-Fe3O4对MB最大吸附量分别为374.4和118.4mg/g.

  • 标签: 石墨烯 磁性 亚甲基蓝 吸附