目的用ESI-TOF-MS分型技术检测线粒体DNA的D环高变区，通过碱基组成分析其多态性。方法在PLEX-ID技术平台上，分别对mtDNA高变区1（HVI，15924-16428nt）和mtDNA高变区Ⅱ（HVⅡ，31-576nt）进行碱基组成分析，考察mtDNA在华东汉族人群的多态性，并将该技术应用于一例特殊的亲子鉴定案件。结果用ESI-TOF-MS分型技术检测线粒体DNA，在高变区Ⅰ的8个区段检见碱基组成的多态性．在mtDNA高变区Ⅱ的10个区段检见多态性。在所应用的亲子鉴定案例中．线粒体DNA标记成了常染色体STR基因座的重要补充．经高变区Ⅰ和高变区Ⅱ的碱基组成检测，最后排除了非母。结论ESI-TOF-MS检测mtDNA的技术具有良好的应用前景，在一些特殊的案件中．该法可为最终获得可靠鉴定结论提供技术支撑。
