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7 个结果
  • 简介:MicroRNAs(miRNAs)是在优核质在许多新陈代谢的活动起关键规章的作用的小、非编码的内长的RNA的一个新奇的班。在Sogatellafurcifera(支持白人的planthopper)的miRNAs的鉴定的报告,那作为唯一扮演的昆虫证实了南部的米饭的向量黑条纹的矮子病毒(SRBSDV),被限制。在这研究,382miRNAs的一个总数在S被识别。furcifera,包括106保存了并且276新奇miRNAs,用从viruliferous和non-viruliferousS的基于二个小RNA图书馆的高产量的定序。furcifera,和这些miRNAs属于52个保存miRNA家庭和58S。furcifera特定的家庭分别地。多于保存miRNA家庭的一半高度在Hexapoda被保存,有从在miRBase的26昆虫种类和五另外的种的miRNAs的比较显示出那,当另外的miRNAs仅仅在non-dipterans被保存时。而且,为382预言的4117目标基因鉴别miRNAs能被分成基因本体论注解的45个功能的组。与non-viruliferous房间相比,八起来调整的miRNAs和四下面调整的miRNAs在与SRBSDV,miR-14和miR-n98a可以在之中涉及对SRBSDV感染的有免疫力的反应接种的房间被识别。识别miRNAs的分析将在涉及新陈代谢,发展和S的病毒的感染的基因的规定和表示提供卓见进这些miRNAs的角色。furcifera。

  • 标签: 白背飞虱 鉴定报告 MIRNAS microRNA 基因本体论 病毒感染
  • 简介:中国白蜡规模昆虫,Ericeruspela,能在-30°C下面在温度在极其低的温度,和某overwintering个人展览supercooling幸存。调查E的深supercooling能力。pela,transcriptomic和proteomic分析被执行描出为overwintering女性的深supercooling能力负责的主要基因和蛋白质家庭。基因本体论(去)基因在表明小径和小径的激活mitogen的蛋白质kinase,钙,和PI3K-Akt包含了,这与可溶的糖,糖白酒和免费氨基酸的生合成联系的分析显示了的基因和染色体(KEGG)的分类和京都百科全书是主导的。为低温度的应力负责的蛋白质例如冷环境适应蛋白质,甘油生合成相关的酶和热吃惊蛋白质(HSP)被识别。然而,防冻剂蛋白质(法新社)都没通过顺序类似搜索方法被识别。一条随机的森林途径在proteome识别了388个通常认为的法新社。法新社基因ep-afp在Escherichiacoli被表示,并且表示蛋白质展出了0.97°C的一项热磁滞现象活动,建议它处于E的深supercooling能力的潜在的角色。pela。

  • 标签: 蛋白质组 过冷能力 抗冻蛋白 白蜡虫 转录组 有丝分裂原活化蛋白激酶
  • 简介:在蚕,白鸡蛋1(w-1)异种,被白眼睛和白鸡蛋描绘,在Bombyxkynurenine3-monooxygenase(KMO)是缺乏的活动。Toinvestigatew-1异种显型是否被介绍野类型的KMO基因救,我们在细胞质的肌动朊基因倡导者(A3KMO)或本国的KMO基因倡导者(KKMO)的控制下面与野类型的BombyxKMO基因构造了转基因的蚕。我们与KKMO构造与A3KMO和一根线创造了二根转基因的线。在这些线的成年人的眼睛是棕色的,并且转基因的女性生的鸡蛋也是棕色的。Reversetranscription聚合酶链反应(RT-PCR)分析证明A3KMO蚕线在中间勇气的、胖身体表示了抄本,并且肾小体小管。KKMO线仅仅在胖身体表示了抄本并且肾小体小管。在转基因的线的眼睛和卵色的紧张与KMO表示水平成正比。有趣地,有A3KMO构造的转基因的幼虫有轻褐幼虫的表皮,而是KKMO线不。这些结果显示野类型的KMO基因能作为标记基因被使用视觉上屏蔽转基因的蚕。

  • 标签: 家蚕 白卵突变体 犬尿氨酸3-单氧酶基因 野生型 转基因系 KMO
  • 简介:【背景】齿裂大戟原产于北美,是近年来入侵我国的一种检疫性杂草。目前,该杂草已在我国的华北、华东和西南建立种群,并呈扩散蔓延趋势。由于该入侵植物具有极强的繁殖能力,一旦大面积扩散势必造成极大损失,急需通过风险评估明确其未来的扩散趋势,进而制定早期预警措施。【方法】使用MAXNET模型,运用齿裂大戟在原产地和中国的已知分布数据及筛选后的环境变量,结合地理信息系统(Geographicinformationsystem,GIS)及其生活史特征和环境适应特性,直观和定量地预测了该原产北美的植物在中国的适生范围,并采用受试者工作曲线(Receiveroperatorcharacteristiccurve,ROC)分析方法对模型预测结果进行了检验。【结果】齿裂大戟在我国有较为广阔的潜在分布区,其中高风险区主要集中在地处33°~40°N,109°~119°E的北京、天津、河北南部、河南北部、山东中北部、山西南部和陕西西安等地。【结论与意义】结合齿裂大戟在我国的分布现状和传入扩散特性,划定了其在我国潜在的高风险区域,为制定预防和控制入侵植物进一步传入和扩散的早期预警和监测措施提供科学依据。

  • 标签: 齿裂大戟 最大熵模型 入侵植物 生态位 潜在分布区预测
  • 简介:【背景】白花鬼针草为农区恶性杂草,原产于美洲,现已广泛分布于世界热带及亚热带地区,但其在全球和中国的适生区域及适生等级还不明确.【方法】利用MaxEnt生态位模型对白花鬼针草在全球以及中国的潜在适生区进行预测.【结果】白花鬼针草在全球的分布更多受到温度因素的影响.白花鬼针草的适生区主要集中在北半球和南半球15°-30°之间的热带和亚热带地区.其中,北美南部、南美中南部、非洲南部、东南亚北部以及大洋洲中南部沿海地区为白花鬼针草中、高度适生区.白花鬼针草在中国的适生区主要位于广东、广西、海南、云南、福建、台湾.到2070年,白花鬼针草在全球的适生区面积与当前相似,但在中国的适生区有所增大.【结论】白花鬼针草在我国有进一步扩张的风险.

  • 标签: MAXENT 白花鬼针草 潜在分布区 预测
  • 简介:[目的]生态位模型在生物地理学、入侵生物学和保护生物学中具有广泛的应用,被越来越多地用于预测物种潜在分布和现实分布的研究中。本文以美国白蛾为例介绍pROC方案在生态位模型评价中的应用及其注意事项,以期对物种潜在分布预测进行合理的评价,促进生态位模型在我国的合理运用和发展。[方法]介绍ROC曲线和AUC值基本原理,总结其在生态位模型评价中的应用,从物种存在分布点和不存在分布点的可信度出发,分析AUC值用于模型评价的优点和不足,最后介绍局部受试者工作特征曲线的线下面积方案(pROC方案)来弥补传统AUC值的不足。[结果]AUC值虽独立于阈值,但因其综合灵敏度和特异度,而屏蔽这2个指标各自的特征,不能分别评估预测结果的灵敏度和特异度,同时对遗漏率和记账错率不能进行权衡,会误导使用者对模型的评价。与AUC值相比,ROC曲线的形状更具有价值,蕴含丰富的模型评价信息。[结论]模型评价需要将灵敏度和特异度区别对待,ROC曲线形状比AUC值在生态位模型评价中更为重要,pROC方案相对于传统AUC值具有优势,但容易对过度模拟做出不当判断。模型评价与作者研究目的密切相关:当以预测物种潜在分布为目的时(如入侵物种潜在分布、气候变化对物种分布的影响和谱系生物地理学),模型评价应当给予灵敏度(或者遗漏率)更多的权重;当以预测物种现实分布为目的时(如保护区界定和濒危物种引入),模型评价应当给予灵敏度和特异度同等的权重。

  • 标签: 生态位模型 灵敏度 特异度 ROC曲线 AUC值 遗漏错误
  • 简介:【目的】生态位模型被广泛应用于入侵生物学和保护生物学研究,现有建模工具中,MaxEnt是最流行和运用最广泛的生态位模型。然而最近研究表明,基于MaxEnt模型的默认参数构建模型时,模型倾向于过度拟合,并非一定为最佳模型,尤其是在处理一些分布点较少的物种。【方法】以茶翅蝽为例,通过设置不同的特征参数、调控倍频以及背景拟不存在点数分别构建茶翅蝽的本土模型,然后将其转入入侵地来验证和比较模型,通过检测模型预测的物种对环境因子的响应曲线、潜在分布在生态空间中的生态位映射以及潜在分布的空间差异性,探讨3种参数设置对MaxEnt模型模拟物种分布和生态位的影响。【结果】在茶翅蝽的案例分析中,特征参数的设置对MaxEnt模型所模拟的潜在分布和生态位的影响最大,调控倍频的影响次之,背景拟不存在点数的影响最小。与其他特征相比,基于特征H和T的模型其响应曲线较为曲折;随着调控倍频的增加,响应曲线变得圆滑。【结论】在构建MaxEnt模型时,需要从生态空间中考虑物种的生态需求,分析模型参数对预测物种分布和生态位可能造成的影响。

  • 标签: 生态位模型 MaxEnt模型 特征参数 调控倍频 背景拟不存在点数