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  • 简介:摘要目的探讨一种基于MRI的深度学习模型预测WHO Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤MGMT甲基化状态的价值。方法回顾性分析2016年6月至2020年6月在兰州大学第二医院经手术病理及分子病理证实的WHO Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤患者121例的临床及影像资料,其中MGMT启动甲基化78例、未甲基化43例。收集121例WHO Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤的T2WI及T1WI增强序列图像,并手动选取每个患者所有包含病灶层面的图像,按照7∶3完全随机分成训练集及验证集。应用EfficientNet-B3卷积神经网络构建独立的基于T2WI、T1WI增强、T2WI联合T1WI增强的预测模型(T2-net、T1C-net、TS-net),通过ROC曲线对各个模型预测效能分别进行评价。结果验证集T2-net模型对WHO Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤MGMT启动甲基化状态预测的准确度为72.3%,灵敏度为64.7%,特异度为73.3%,曲线下面积(AUC为0.72),T1C-net模型的准确度为66.8%,灵敏度为68.3%,特异度为66.9%,AUC为0.72,TS-net模型的准确度为81.8%,灵敏度为63.1%,特异度为85.0%,AUC为0.78。结论基于MRI的EfficientNet-B3卷积神经网络可以预测WHOⅡ、Ⅲ胶质瘤MGMT启动甲基化状态;TS-net模型预测性能最佳。

  • 标签: 神经胶质瘤 磁共振成像 O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶 深度学习
  • 简介:摘要目的应用全外显测序技术探讨端粒酶反转录酶(TERT)启动突变在脑胶质瘤分子分型诊断中的价值。方法回顾性纳入2016年3月至2018年10月于山东大学齐鲁医院神经外科行手术治疗且术后病理学检查确诊为脑胶质瘤的135例患者,利用全外显测序技术检测其胶质瘤相关分子特征,分析TERT启动突变与其他胶质瘤分子特征以及肿瘤病理学类型的关系,从而探讨TERT启动突变在胶质瘤分子分型诊断中的价值。结果135例患者中,35例(25.9%)存在TERT启动突变,且TERT启动突变与染色体1p/19q联合缺失有关(χ2=14.190,P<0.001),而与异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变无明显相关(χ2=0.827,P=0.363)。在世界卫生组织(WHO) Ⅱ级和Ⅲ级IDH突变型星形细胞瘤以及WHO Ⅳ级IDH突变型胶质母细胞瘤组(简称星形-突变型组)中,TERT启动的突变率低于WHO Ⅱ级和Ⅲ级的IDH突变伴染色体1p/19q联合缺失型少突胶质细胞瘤组(简称少突组)以及WHO Ⅳ级IDH野生型胶质母细胞瘤、IDH野生型巨细胞型胶质母细胞瘤和IDH野生型胶质肉瘤组(简称胶母-野生型组)(均P<0.001),而少突组与胶母-野生型组之间TERT启动突变率的差异无统计学意义(P>0.05)。WHO Ⅱ级和Ⅲ级星形细胞瘤患者中,无一例同时存在TERT启动突变与IDH基因突变。结论TERT启动突变主要存在于IDH突变伴染色体1p/19q联合缺失型少突胶质细胞瘤以及IDH野生型胶质母细胞瘤患者中。TERT启动突变与IDH基因突变同时存在可能能够排除WHO Ⅱ、Ⅲ级星形细胞瘤的诊断。

  • 标签: 神经胶质瘤 诊断 分子分型 点突变 端粒酶反转录酶
  • 简介:摘要溶瘤腺病毒(OA),也称为条件增殖型腺病毒,是经基因改造,只在肿瘤细胞中特异增殖的新一代腺病毒载体,此载体对正常细胞无影响。其能感染特定类型肿瘤细胞,通过复制、增殖、裂解并杀伤肿瘤细胞,同时利用其高效的转染效率携带治疗基因,以此提高抗肿瘤效果,利用肿瘤特异性启动是构建OA的主要方法。本文概述了肿瘤特异性启动在OA治疗泌尿系肿瘤中的研究进展。

  • 标签: 泌尿系肿瘤 溶瘤腺病毒 转录启动子
  • 简介:摘要目的应用全外显测序技术探讨端粒酶反转录酶(TERT)启动突变在脑胶质瘤分子分型诊断中的价值。方法回顾性纳入2016年3月至2018年10月于山东大学齐鲁医院神经外科行手术治疗且术后病理学检查确诊为脑胶质瘤的135例患者,利用全外显测序技术检测其胶质瘤相关分子特征,分析TERT启动突变与其他胶质瘤分子特征以及肿瘤病理学类型的关系,从而探讨TERT启动突变在胶质瘤分子分型诊断中的价值。结果135例患者中,35例(25.9%)存在TERT启动突变,且TERT启动突变与染色体1p/19q联合缺失有关(χ2=14.190,P<0.001),而与异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变无明显相关(χ2=0.827,P=0.363)。在世界卫生组织(WHO) Ⅱ级和Ⅲ级IDH突变型星形细胞瘤以及WHO Ⅳ级IDH突变型胶质母细胞瘤组(简称星形-突变型组)中,TERT启动的突变率低于WHO Ⅱ级和Ⅲ级的IDH突变伴染色体1p/19q联合缺失型少突胶质细胞瘤组(简称少突组)以及WHO Ⅳ级IDH野生型胶质母细胞瘤、IDH野生型巨细胞型胶质母细胞瘤和IDH野生型胶质肉瘤组(简称胶母-野生型组)(均P<0.001),而少突组与胶母-野生型组之间TERT启动突变率的差异无统计学意义(P>0.05)。WHO Ⅱ级和Ⅲ级星形细胞瘤患者中,无一例同时存在TERT启动突变与IDH基因突变。结论TERT启动突变主要存在于IDH突变伴染色体1p/19q联合缺失型少突胶质细胞瘤以及IDH野生型胶质母细胞瘤患者中。TERT启动突变与IDH基因突变同时存在可能能够排除WHO Ⅱ、Ⅲ级星形细胞瘤的诊断。

  • 标签: 神经胶质瘤 诊断 分子分型 点突变 端粒酶反转录酶
  • 简介:摘要目的探讨启动甲基化调控的抑瘤素M受体(OSMR)在胃癌中的表达及其作用。方法在UCSC Xena数据库中采用Student t检验和皮尔森相关性检验分析OSMR基因及其启动甲基化在胃癌中的表达及其调控关系。收集武汉大学中南医院2014年2月至2016年6月的80例人胃癌组织,经免疫组织化学实验检测OSMR蛋白表达水平,然后采用卡方检验分析OSMR蛋白表达量与患者临床资料的关系。结果UCSC Xena数据库分析表明OSMR mRNA在胃癌组织中(14.752±7.593)高于癌旁组织(8.098±3.457,t=-8.938,P<0.01),而OSMR启动甲基化在胃癌组织中(0.195±0.104)低于癌旁组织(0.463±0.187,t=9.372,P<0.01)。相关分析结果表明OSMR启动甲基化与其基因表达呈负相关(R=-0.562,t=-14.517,P<0.01)。Kaplan-Meier生存分析结果表明OSMR蛋白表达水平与患者总体生存时间负相关[风险比(HR)=1.535,95%可信区间(CI):1.214~1.873,P<0.01]。χ2检验结果表明OSMR蛋白高表达与肿瘤分化(χ2=9.389,P<0.01)、TNM分期(χ2=8.166,P<0.01)和淋巴结转移(χ2=4.233,P<0.05)明显相关。结论启动甲基化调控的OSMR在胃癌中高表达,且其表达量与患者的预后呈负相关。

  • 标签: 启动子甲基化 胃癌 预后
  • 简介:摘要BRAFV600E突变是甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)较常见的基因突变,与PTC的发生、发展及预后存在相关性。TERT启动突变在PTC中少见,但伴有其突变的PTC具有侵袭性更强、预后更差的特点。临床上,少部分PTC患者同时伴有BRAFV600E和TERT启动突变,本文从BRAFV600E和TERT启动共同突变与PTC的发生发展、临床诊断、手术策略、术后辅助治疗及预后等方面进行简要阐述。

  • 标签: BRAFV600E TERT启动子 甲状腺乳头状癌 基因突变
  • 简介:摘要宫颈癌是最常见的妇科恶性肿瘤之一。目前人乳头瘤病毒(HPV)检测及细胞学检查是宫颈癌及其癌前病变(CCPL)的主要筛查手段。由于上述传统筛查方法,仍然存在对CCPL漏诊的风险,因此寻找有效识别CCPL的特异性分子标志物,具有重要临床意义。对具有序列相似性家族19成员A4(FAM19A4)基因启动甲基化定量检测,可有效检出CCPL组织,较传统筛查方法有较高特异度,有望成为CCPL筛查的特异性分子标志物。笔者拟就FAM19A4基因启动甲基化定量检测,在CCPL筛查中应用的最新研究现状进行阐述,旨在为进一步推进CCPL筛查方法的开发,提供思路。

  • 标签: 宫颈肿瘤 癌前状态 分子靶向治疗 分子标志物 DNA甲基化 FAM19A4 启动区,遗传 女(雌)性
  • 简介:摘要目的旨在采用二代测序(NGS)的技术平台检测肝细胞癌(HCC)组织样本中肿瘤抑制基因第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源等位基因(PTEN)基因启动区的甲基化率,并对其与接受索拉非尼治疗患者预后相关性进行分析。方法2019年6月至2020年12月期间,对在解放军总医院第五医学中心收集和保存的52例单纯接受索拉非尼治疗患者的HCC成对肿瘤组织与癌旁组织样本,提取样本中的总DNA样品;使用亚硫酸氢盐处理DNA样品并设计特异性引物对PTEN启动区进行扩增,进一步对扩增产物进行二代测序分析。在对PTEN甲基化的临床意义分析中通过log-rank统计学分析方法计算患者组间生存期是否具有统计学差异。结果肿瘤组织中PTEN启动区甲基化率(29.17%±9.58%)显著高于癌旁组织(4.17%±2.86%)(t=19.970,P<0.05)。同时,在HCC组织中,PTEN启动区甲基化率与其表达负相关(F=47.270,P<0.000 1;Y=-1 800×X+38.03),PTEN甲基化率与患者接受分子靶向药物索拉非尼治疗的预后负相关(χ²=4.313,P<0.05)。结论本研究成功建立了新型PTEN启动区甲基化的检测方法,PTEN甲基化率可能是HCC诊断及靶向治疗的靶标之一。

  • 标签: 甲基化 肝细胞癌 下一代测序技术
  • 简介:摘要特发性肺纤维化(IPF)是一种与年龄相关的慢性、进行性间质性肺疾病,其病因不明,确诊后患者中位生存期为3~5年。研究表明IPF的发生可能与基因易感的个体在反复的肺泡损伤后产生异常的修复反应相关。随着基因测序技术的不断发展,研究发现遗传因素在IPF的发生中有着重要的作用。家族性肺纤维化(FPF)约占总IPF患者的2%~20%,表现为常染色体不完全显性遗传。MUC5B启动基因多态性在散发IPF和FPF中是常见的,其中一个功能获得启动rs35705950的多态性被认为是IPF发生的最强风险因素,这表明MUC5B启动rs35705950基因多态性与IPF的发生有着密切的关联。

  • 标签: 特发性肺纤维化 MUC5B 启动子基因多态性 rs35705950
  • 简介:摘要目的构建乙型肝炎病毒(HBV)C启动近端肝富集转录因子结合位点突变的重组HBV复制型质粒,以期阐明其在HBx增强HBV复制中的作用。方法利用定点突变技术在野生型HBV复制型质粒和HBx表达缺失的HBV复制型质粒基础上构建HBV C启动近端肝富集转录因子结合位点突变的重组质粒。随后在HBV肝癌细胞复制模型和小鼠复制模型中进行质粒转染,提取细胞和小鼠肝组织的HBV复制中间体进行检测。结果在HBV复制型质粒的基础上成功构建HBV C启动近端肝富集转录因子结合位点突变的HBV复制型质粒。在HBV肝癌复制模型和小鼠复制模型中均发现HBx增强HBV的复制。突变HBV C启动肝富集转录因子结合位点以后,HBx对于HBV复制增强的作用并未受到显著影响。结论HBx增强HBV复制可能不通过肝富集转录因子和与HBV C启动近端的结合位点而起作用,其他肝富集转录因子结合位点在HBx增强HBV复制中的作用仍需进一步研究。

  • 标签: 乙型肝炎病毒 肝富集转录因子 乙型肝炎病毒x蛋白 定点突变
  • 简介:摘要目的观察长链非编码RNA(lncRNA)叉头框蛋白C1(FOXC1)基因启动上游转录体(FOXCUT)调控JAK信号在乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用。方法采用实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测lncRNA FOXCUT在乳腺癌细胞株(MCF-7和MDA-MB-231)和人正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)中的表达。体外干扰lncRNA-FOXCUT在乳腺癌细胞MCF-7中表达,利用细胞计数试剂盒(CCK-8)法、伤口愈合法和细胞侵袭实验检测lncRNA FOXCUT对乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。同时,用qRT-PCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测B细胞淋巴瘤2(bcl-2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)和Janus激酶1(JAK1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)的表达。多组间比较采用单因素方差分析,两两比较采用SNK-q检验。结果lncRNA FOXCUT在乳腺癌细胞MCF-7(1.567±0.270,t=5.086,P<0.01)和MDA-MB-231(1.513±0.387,t=3.533,P<0.01)中表达明显高于MCF-10A细胞(1.004±0.193),差异有统计学意义。siRNA-FOXCUT组细胞增殖活力明显低于NC组(48 h时0.790±0.068比0.991±0.165,t=2.516,P<0.05;72 h时0.928±0.135比1.500±0.311,t=3.775,P<0.01),差异有统计学意义。同时,siRNA-FOXCUT组MCF-7细胞的迁移率[(30.163±4.133)%比(79.330±4.952)%,t=13.200,P<0.01]和侵袭[(101.000±13.115)个比(244.667±18.771)个,t=10.870,P<0.01]能力均低于NC组,差异有统计学意义。siRNA-FOXCUT组细胞中bcl-2(0.565±0.058比1.075±0.242,t=3.555,P<0.01)和MMP-9(0.527±0.138比0.982±0.172,t=3.574,P<0.01)在mRNA和蛋白水平均低于NC组,同时p-JAK1(0.185±0.031比1.095±0.134,t=11.460,P<0.01)和p-STAT3(0.298±0.029比0.948±0.235,t=4.755,P<0.01)蛋白表达低于NC组,差异有统计学意义。结论lncRNA FOXCUT可能通过JAK1/STAT3途径参与调控乳腺癌的增殖、迁移和侵袭。

  • 标签: 乳腺癌 长链非编码RNA 增殖 迁移 侵袭
  • 简介:摘要目的研究IL-10启动区-592A/C(rs1800872)和-1082A/G(rs1800896)位点单核苷酸多态性(SNP)与梅毒血清固定易感性之间是否存在关联。方法应用多重单碱基延伸(SNaPshot)技术检测2019年1月至12月就诊于徐州医科大学附属医院收治的123例梅毒血清固定患者、118例梅毒血清转阴患者和120例健康人群对照的IL-10启动区-592A/C和-1082A/G位点SNP,比较不同研究对象临床特点、基因型及等位基因频率差异。结果血清固定组与血清转阴组和健康对照组年龄、性别差异无统计学意义(P>0.05)。血清固定组与血清转阴组性伴侣数量、初始RPR滴度、分期、吉海反应差异无统计学意义(P>0.05)。在IL-10启动区-592A/C与-1082A/G位点,血清固定组与血清转阴组和健康对照组比较,基因型及等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论IL-10启动区-592A/C和-1082A/G位点SNP与梅毒血清固定易感性之间无显著相关。

  • 标签: 白细胞介素10 多态性,单核苷酸 梅毒血清诊断
  • 简介:摘要目的研究IL-10启动区-592A/C(rs1800872)和-1082A/G(rs1800896)位点单核苷酸多态性(SNP)与梅毒血清固定易感性之间是否存在关联。方法应用多重单碱基延伸(SNaPshot)技术检测2019年1月至12月就诊于徐州医科大学附属医院收治的123例梅毒血清固定患者、118例梅毒血清转阴患者和120例健康人群对照的IL-10启动区-592A/C和-1082A/G位点SNP,比较不同研究对象临床特点、基因型及等位基因频率差异。结果血清固定组与血清转阴组和健康对照组年龄、性别差异无统计学意义(P>0.05)。血清固定组与血清转阴组性伴侣数量、初始RPR滴度、分期、吉海反应差异无统计学意义(P>0.05)。在IL-10启动区-592A/C与-1082A/G位点,血清固定组与血清转阴组和健康对照组比较,基因型及等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论IL-10启动区-592A/C和-1082A/G位点SNP与梅毒血清固定易感性之间无显著相关。

  • 标签: 白细胞介素10 多态性,单核苷酸 梅毒血清诊断
  • 简介:摘要目的研究妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)患者肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)启动区甲基化状态与GDM之间的相关性,为GDM的诊断治疗提供新的思路和方法。方法采用焦磷酸测序技术检测41例GDM患者和38例健康产妇胎盘组织的TNF-α启动区甲基化水平,采用实时荧光定量PCR检测TNF-α的表达量。结果相较于正常对照组,GDM组在年龄和分娩孕周方面差异无统计学意义;TNF-α启动区的平均甲基化值显著降低(P=0.038),在选取的9个CpG位点中,4个位点甲基化水平显著降低(CpG2:P=0.012,CpG3:P=0.010,CpG6:P=0.019,CpG7:P=0.046);GDM组TNF-α表达水平显著上调(P=0.011);胎盘组织TNF-α基因启动区平均甲基化值与TNF-α基因的mRNA表达呈负相关(r=-0.513,P<0.001)。结论GDM患者TNF-α启动区甲基化程度较健康产妇显著降低,且与其mRNA表达呈负相关,提示TNF-α甲基化水平与GDM发生发展密切相关。

  • 标签: 妊娠期糖尿病 肿瘤坏死因子α 甲基化
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  • 简介:摘要:随着社会的不断进步和发展,核心综合素养和智慧课堂已成为现在教学当中的热点。核心综合素养是教育的落实目标,智慧课堂是教育不断完善下的产物,其两者的融合是必然的走向。本文主要从核心综合素养下小学英语智慧课堂的原则以及如何在核心综合素养下构建小学英语的智慧课堂两个方面进行了详细的探索。

  • 标签: 核心素养 小学英语 智慧课堂 构建研究
  • 简介:摘要目的在中国汉族小耳畸形核心家系中评估基因新生突变模式在散发小耳畸形中的作用,寻找可能的致病性新生突变。方法选取2017年3月至2018年7月就诊于中国医学科学院整形外科医院的24个中国单纯小耳畸形核心家系。其中小耳畸形患者24例,年龄6~10岁,男15例,女9例,均为单侧小耳畸形,包括左侧15例,右侧9例。获知情同意后,抽取患者及其未患病双亲的外周血,对24个单纯小耳畸形患者及其未患病双亲进行全外显组测序,筛选位于基因编码区及经典剪接位点的新生突变,观察每例患者外显子区的新生突变数量。对筛选到的新生突变依美国医学遗传学与基因组学会变异分类标准进行分类,使用ExAc数据库、VarCards数据库、Human Splicing Finder 3.1在线软件分别对丧失功能突变、错义突变和同义突变进行变异特征判断,结合小鼠基因组信息数据库查询同源基因在小鼠鳃弓部位的表达情况、使用David6.8生物信息数据库对候选基因进行通路富集分析,使用在线人类孟德尔疾病遗传数据库查询候选基因与人类疾病之间的对应关系,从而对不同变异进行变异功能和基因功能2方面的致病性评估。结果24个小耳畸形家系中共检测到23个新生突变,每个患者检测到0~3个外显子区新生突变,与正常人相比未见明显增加。突变类型包括错义突变12个、同义突变8个以及无义突变、起始密码子突变、整码插入突变各1个。其中LRP12基因无义突变依指南分类为致病变异。使用多种生物信息学软件及数据库对所有新生突变进行分析,未见明显的致病性特征。结论小耳畸形患者中并没有发现明显的新生突变负担加重,尽管致病基因可能通过新生突变模式在小耳畸形中致病,但新生突变模式可能不是小耳畸形致病的主要遗传模式。

  • 标签: 先天性小耳 遗传方式 突变
  • 简介:摘要: 新疆华电喀什热电公司为2Χ350MW超临界发电机组,锅炉是哈尔滨锅炉厂有限责任公司自主开发设计、制造的一次中间再热、超临界压力变压运行直流锅炉,采用单炉膛、平衡通风、固态排渣、全钢架悬吊结构、π型布置的HG-1140/25.4-YM1型超临界直流锅炉。汽轮机是上海电气电站设备有限公司上海汽轮机厂采用高中压缸联合启动或高压缸启动方式技术设计制造的CJK350-24.2/0.4/566/566型(合缸)型超临界,一次中间再热、表凝式间接空冷、单抽汽(采暖抽汽)凝汽式汽轮机。发电机为上海电气电站设备有限公司上海发电机厂生产的QFS2-350-2型“双水内冷”三相同步汽轮发电机,发电机额定容量 412MVA,额定功率因数 0.85,额定输出功率 350MW,最大连续输出功率 385MW。当两台350MW机组均故障停运或一台机组检修另一台机组事故停运后全厂无外来启动汽源情况下,再次投运时,经过采取利用锅炉余热,经过主蒸汽高旁管路与凝结水启动冲洗水系统配合使用产生一定压力和温度蒸汽,确保轴封供汽的同时尽快投汽动给水泵,恢复锅炉水循环,具备锅炉点火启动条件,实现机组自启动目的,利用停机机会按照方案论证冷态、热态或极热态机组能否实现自启动成功,以故障机组尽快恢复至正常运行方式为目的,恢复全厂辅助蒸汽系统,减少经济损失,并结合现场特点,特制定本方案。

  • 标签: 热态机组 无启动蒸汽 应急自启动方案
  • 简介:摘要:《慎》一书在先秦时期占有重要地位。研究《慎》对我们深入研究先秦学术史、思想史具有非常重要的意义。通过对文本进行精细解读,研究《慎》中所出现的特殊的文言句式,如判断句、省略句、被动句、双宾语句、宾语前置句,总结归纳句式的使用情况,有助于反映先秦时期文言句式的发展情况。对《慎》中的文言句式进行研究总结,这仅仅是最基础的,将来还应当进一步的进行研究。同时将《慎》和《论语》两部著作中的文言句式进行比较,以此观察先秦时期文言句式的发展情况。

  • 标签: 《慎子》 《论语》 文言句式