简介:Theexplosivegrowthofthebioinformaticsfieldhasledtoalargeamountofdataandsoftwareapplicationspubliclyavailableaswebresources.However,thelackofpersistenceofwebreferencesisabarriertoacomprehensivesharedaccess.Weconductedastudyofthecurrentavailabilityandotherfeaturesofprimarybioinfor-maticswebresources(suchassoftwaretoolsanddatabases).Themajority(95%)oftheexaminedbioinformaticswebresourceswerefoundrunningonUNIX/Linuxoperatingsystems,andthemostwidelyusedwebserverwasfoundtobeApache(orApache-relatedproducts).Oftheoverall1,130UniformResourceLocators(URLs)examined,91%werehighlyavailable(morethan90%ofthetime),whileonly4%showedlowaccessibility(lessthan50%ofthetime)duringthesurvey.Furthermore,themostcommonURLfailuremodesarepresentedandanalyzed.
简介:Itiswidelyrecognizedthatexchange,distribution,andintegrationofbiologicaldataarethekeystoimprovebioinformaticsandgenomebiologyinpost-genomicera.However,theproblemofexchangingandintegratingbiologicaldataisnotsolvedsatisfactorily.TheeXtensibleMarkupLanguage(XML)israpidlyspreadingasanemergingstandardforstructuringdocumentstoexchangeandintegratedataontheWorldWideWeb(WWW).WebserviceisthenextgenerationofWWWandisfoundedupontheopenstandardsofW3C(WorldWideWebConsortium)andIETF(InternetEngineeringTaskForce).ThispaperpresentsXMLandWebServicestechnologiesandtheiruseforanappropriatesolutiontotheproblemofbioinformaticsdataexchangeandintegration.
简介:PBONDisawebserverthatpredictstheconformationofthepeptidebondbetweenanytwoaminoacids.PBONDclassifiesthepeptidebondsintooneoutoffourclasses,namelycisimide(cis-Pro),cisamide(cis-nonPro),transimide(trans-Pro)andtransamide(trans-nonPro).Moreover,foreverypredictionareliabilityindexiscomputed.Theunderlyingstructureoftheserverconsistsofthreestages:(1)featureextraction,(2)featureselectionand(3)peptidebondclas-sification.PBONDcanhandlebothsinglesequencesaswellasmultiplesequencesforbatchprocessing.Thepredictionscaneitherbedirectlydownloadedfromthewebsiteorreturnedviae-mail.ThePBONDwebserverisfreelyavailableathttp://195.251.198.21/pbond.html.
简介:
简介:Mycobacterium肺结核(鱼雷快艇),肺结核的原因的代理人,是这个世纪的大多数畏惧的疾病之一。它被研究人员长用各种各样的湿实验室、干燥实验室的技术在全世界学习了。在这研究,我们在能在silico被申请的genomic水平在采矿上集中有用模式从鱼雷快艇建筑群的基因的功能的描述。根据在这研究发现的模式开发的模型能正确地从鱼雷快艇紧张H37Rv的染色体识别99.77%输入基因。模型对四另外的鱼雷快艇紧张和相当或相同事物M被测试。bovis将进一步评估它的归纳能力。吝啬的预言精确性是85.76%。GC内容在整个染色体仍然保持相当不变,这也被观察,含有任何致病力岛的缺席从另外的有机体转了。这研究表明dinucleotide作文是为鱼雷快艇建筑群的一个有效的功能的班辨别者。为了便于这个模型,的应用程序,网服务器澡盆基因被开发了,它能自由地在http://www.bifmanit.org/tb2/被存取。
简介:在染色体为特定的DNA目标设计锌手指蛋白质主题在染色体工程的领域里是批评的。我们为为绑在特定的目标DNA地点的C2H2锌手指预言识别helices开发了一个计算方法。这预言用锌手指蛋白质和他们的目标DNA三位字节的彻底的数据集基于人工的神经网络。用户们能为也要预言在的二或三根锌手指选择选择一模块化或为输入DNA顺序的synergistic时尚。这个方法将为对为几个生物、生物医学的应用程序设计特定的锌手指抄写因素和锌手指核酸酶感兴趣的研究人员是珍贵的。网工具ZiF预言在http://web.iitd.ac.in/sundar/zifpredict/在网上是可得到的。
简介:车站编组自动化设备的应用极大地提高了列车编组安全性和效率,使用DYT可控停车防溜器制动防溜,减轻了作业人员的工作条件和劳动强度,提高了站场自动化作业的水平。文章对DYT停车器的维修与管理进行了探讨与研究,提出设备更新时的一些改进思路。
简介:目的:探讨健康管理理念在体检服务中的应用.方法:选取2014年2月~2015年2月来自我院体检者1200名为研究对象,回顾性分析其临床资料,在体检服务中应用健康管理理念,观察患者的体检结果与护理效果.结果:本组1200名体检者,前5位疾病检出率分别为脂肪肝、高脂血症、甲状腺结节、前列腺肥大或增生与骨量减少;在前5位高发疾病中,男女异常检出率比较,差异有统计学意义(P〈0.05);经健康管理,健康教育普及率为100%,体检对象对自身健康状况与相关知识知晓率为92.92%,体检对象的护理满意率为92.58%.结论:在体检服务中应用健康管理理念,实现了疾病的及早发现与治疗,降低了疾病患病率,提高了患者生存质量.
简介:目的了解引起夫妻双方生殖器念珠菌病的病原菌是否为同一种致病菌,并行药物敏感性检测,以指导临床治疗。方法采用常规念珠菌培养方法培养,API20CAUX进行鉴定,微量稀释法行药敏检测。结果88例患者(44对夫妻)中,检出白念珠菌73例。夫妻双方共同由同一菌种致病例数为41对,白念珠菌引起者为36对,光滑念珠菌引起者为2对,近平滑2对,克柔念珠菌1对。与对照组相比,差异有统计学意义。体外药敏显示88株念珠菌对制霉菌素全部敏感,对克霉唑也高度敏感,对伊曲康唑、氟康唑有不同程度的耐药。结论夫妻一方患有生殖器念珠菌病时,另一方应做好性伴通知工作,行相应检查,必要时行药敏实验,以降低念珠菌病的复发率。