简介：摘要目的开展2016—2018年长沙市人群感染和活禽市场(live poultry markets, LPMs)环境污染H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)监测，为防控人感染H5N6亚型AIV提供实验室数据。方法采集2016—2018年长沙市流感样病例和不明原因肺炎病例咽拭子6 909份及LPMs环境样品1 719份，利用实时RT-PCR进行A型、H5、H7、H9和N6亚型AIV核酸扩增，并对82份AIV核酸阳性样品进行高通量核苷酸测序，然后对测序结果进行BLAST比对和氨基酸(amino acids, aa)关键位点分析。结果从6 909份病例的咽拭子样品中检出H5N6亚型AIV核酸阳性1份，从1 719份LPMs环境样品中检出A型AIV核酸阳性927份(53.93%)，H5N6亚型AIV核酸阳性193份(11.23%)。高通量核苷酸测序获得14株H5N6亚型AIV的基因组序列，aa关键位点分析显示病毒血凝素(hemagglutinin, HA)蛋白连接肽第338～347位出现6个碱性aa，对禽表现为高致病性的分子特征，受体结合位点(receptor binding site, RBS)第238～240位aa(对应H3型流感病毒第226～228位编码aa)为QSG或QRG，受体特征为禽源。神经氨酸酶(neuraminidase, NA)蛋白第290位耐药基因位点aa未出现R290K突变现象，对NA抑制剂(达菲/磷酸奥司他韦)敏感；病毒PB2蛋白发生E627K和D701N(I)突变，表明病毒致病力强。结论长沙市人群感染H5N6亚型AIV为偶发，LPMs环境H5N6亚型AIV污染较重，需要进一步加强LPMs环境AIV监测。