简介:摘要目的软组织肉瘤是一种罕见的肿瘤,且预后极差,需要深入研究分子机制促进新的治疗策略的发展。方法为了确定软组织肉瘤发生发展过程中的候选基因,我们从基因表达综合数据库下载了GSE2719基因芯片数据集。运用Perl软件和R软件整理数据,分析正常组织与癌组织的差异表达,筛选出具有统计学意义的基因,并用Oncomine数据库进行Meta分析。随后利用R软件对单基因进行差异分析及相关性分析。用STRING工具构建了蛋白质相互作用网络,并用Cytoscape进行了模块分析。基于TCGA数据进行了AZGP1的生存分析。结果共筛选出10个基因:AZGP1、CUX2、CXCL14、NCAM1、PCDH8、PLP1、SCG3、SCG5、SERPINA3、WIF1,其中AZGP1、CXCL14、PLP1、SERPINA3基因在正常组织与癌组织中的差异表达有统计学意义(均P<0.01)。Meta分析显示AZGP1、CXCL14、SERPINA3基因在肿瘤组织中比正常组织的显著下调(均P<0.05)。单基因差异分析发现AZGP1基因在各类分型中的低表达更显著。相关性分析示AZGP1和PRSS8、TM7SF2基因呈显著正相关性。差异基因的富集功能和途径包括细胞周期相变的调节、有丝分裂细胞周期相变的调控、细胞器裂变、细胞周期过程的负调控、细胞循环和DNA复制。肿瘤组织中AZGP1低表达与肉瘤患者较低的总生存相关。结论AZGP1基因在软组织肉瘤中表达下调,并可能影响患者总生存。
简介:摘要肺癌是全球发病率最高、死亡人数最多的恶性肿瘤,非小细胞肺癌占肺癌发病率80%~85%,内科治疗是非小细胞肺癌综合治疗的重要组成部分。然而,相同类型的非小细胞肺癌患者在接受同种方案治疗时,疗效差异较大。虽然既往研究从肿瘤异质性、分子生物学个体化差异等角度探讨其原因,但目前临床仍缺乏有效的疗效预测标记物。在二代测序广泛应用的背景下,探索新型疗效预测标记物的研究已成为热点。前期多项研究发现,肿瘤突变负荷与非小细胞肺癌免疫治疗疗效呈正相关;近期相关研究发现,其对靶向治疗及化疗的疗效亦有一定的预测价值。现就肿瘤突变负荷对非小细胞肺癌系统性治疗疗效预测的相关研究进行综述,旨在更好地服务于个体化、精准化治疗。