明末清初的粤东北地区，先是发生地区性的动乱，后为全国性的王朝更替之乱，社会动荡不安。崇祯元年（1628），镇平县发生苏峻等“五总之变”，引起粤东地方社会动荡，一直延至明末。明亡后，粤东土豪竞起，先后有江龙、刘良机、吴六奇等占据程乡、大埔。至顺治八年，始归人清朝版图。但至顺治十年，又经历郝尚久反清复明之变。而在沿海，郑成功的南明势力与清兵在潮州地区进行了长达9年的拉锯战，直至康熙元年（1662）据守南澳的郑军将领陈豹向清朝投降。康熙十二年又卷入“三藩之乱”，潮州再次成为主战场之一。直至康熙十六年，刘进忠投降清朝。康熙十九年清兵攻克达濠寨，丘辉逃往台湾。从此，清王朝对潮州的统治终于得以稳固下来。康熙二十三年（1684），清政府统一台湾，同年开海禁。至此，粤东地方近60年的地方动乱局面，终于结束，地方社会秩序渐趋稳定。
