利用微卫星（SSR）标记技术，从600对SSR引物中筛选86对扩增条带清晰的引物，检测了来自我国不同地区37个肉质不同颜色萝卜品种的遗传多样性。86对引物共扩增到976个条带，每对引物扩增出2～17个条带，平均为10．7个，其中多态性条带892个，多态性条带比例为91．39％；共检测出753个基因型，每对引物检测2—20个基因型，平均8．7个，其中有效基因型443．99，有效基因型比例为58．96％；Shannon多态性指数变幅为0．44～2．77，平均1．76。当相似系数为0．81时，可将供试萝卜分成3类，第1类包括6份白色肉质萝卜，第11类包括3份红色肉质萝卜和6份白色肉质萝卜，第1II类包括22份红色肉质萝卜。各红色肉质萝卜品种间的遗传相似系数有97％大于0．80，而各白色肉质萝β品种间的遗传相似系数有91％大于0．80。红色肉质萝卜遗传多样性略低于白色肉质萝卜，红色肉质萝p与白色肉质萝P间平均相似系数为O．83，说明不同肉色的萝卜间亲缘关系较密切，在分类上红色肉质萝卜可能是白色萝卜的一个变种。
