简介：Thethree-dimensional(3D)structurepredictionofproteinsisanimportanttaskinbioinformatics.Findingenergyfunctionsthatcanbetterrepresentresidue-residueandresidue-solventinteractionsisacrucialwaytoimprovethepredictionaccuracy.Thewidelyusedcontactenergyfunctionsmostlyonlyconsiderthecontactfrequencybetweendifferenttypesofresidues;however,wefindthatthecontactfrequencyalsorelatestotheresiduehydrophobicenvironment.Accordingly,wepresentanimprovedcontactenergyfunctiontointegratethetwofactors,whichcanreflecttheinfluenceofhydrophobicinteractiononthestabilizationofprotein3Dstructuremoreeffectively.Furthermore,afoldrecognition(threading)approachbasedonthisenergyfunctionisdeveloped.Thetestingresultsobtainedwith20randomlyselectedproteinsdemonstratethat,comparedwithcommoncontactenergyfunctions,theproposedenergyfunctioncanimprovetheaccuracyofthefoldtemplatepredictionfrom20%to50%,andcanalsoimprovetheaccuracyofthesequence-templatealignmentfrom35%to65%.

简介：象从应用Biosys-tems的AB1700站台那样的新奇微数组技术在信号答应重要增加为微弱地表示的抄本的动态范围和更高的敏感。我们把AB1700数据的一个代表性的集合与同样代表性的AffymetrixHG-U133A数据集作比较。AB1700设计扩大信号在由一个数量级的更低的界限的动态察觉范围。这些高敏感的数据的日志正常信号分发侧面需要被二独立分布表示。另外的秒分发盖住将用Affymetrix技术变未被发现的那些抄本。在AB1700数据的信号依赖者变化分发是信号紧张的重要功能，用合成功能可记述。这些高敏感的transcriptome侧面的急速地不同的结构要求改编或甚至标准微数组分析方法的重新开发。基于统计性质，我们为为如此的开发是必要的AB1700数据导出一个信号变化分发模型。有趣地，在AB1700数据观察的双木头正常分发反映抄写开始的二根本上不同的生物学的机制。

简介：螺旋体serovars引起的威胁生活的感染为设计反细螺旋体病药要求需要。现在的学习包含对螺旋体的phosphoheptoseisomerase(GmhA)探索禁止者，它为lipopolysaccharide(LPS)是重要的生合成并且通过减少性的genomic途径作为一个普通的药目标被识别。GmhA模型在Modeller9v7被造。预言的模型的结构的精炼和精力最小化用艺术大师9.0被执行。精制模型可靠性通过Procheck，ProSA，ProQ和侧面3D被估计。基于底层虚拟高产量的屏蔽(VHTS)在Ligand。信息元数据库工具产生了354底层的一个内部图书馆结构的类似物。而且，从有每ligand的不同符合构造的内部图书馆的基于结构的VHTS提供了14个新奇竞争禁止者。和从VHTS获得的卓见的模型将是为开发反细螺旋体病的一个有希望的起点竞争禁止者指向LPS生合成小径。

简介：Humanleukocyteantigen(HLA)systemisthemostpolymorphicregionknowninthehumangenome.Inthepresentstudy,weanalyzedforthefirsttimetheHLA-Agenepolymorphismsdefinedbythehigh-resolutiontypingmethods-sequence-basedtyping(SBT)in161NorthernChineseHanpeople.Atotalof74differentHLA-Agenetypesand36allelesweredetected.ThemostfrequentalleleswereA110101(GF=0.2360)，A24020101（GF=0.1646），andA020101(GF=0.1553)；followedbyA3303(GF=0.1180)，A3001（GF=0.0590)，andA310102(GF=0.0404).Thefrequenciesoffollowingalleles,A0203,A0205,A0206,A0207,A030101,A2423,A2601,A3201,andA3301,areallhigherthan0.0093.ThehomozygousallelesincludeA020101,A110101,A24020101andA310102.Heterozygosity(H),polymorphisminformationcontent(PIC),discriminationpower(DP)andprobabilityofpaternityexclusion(PPE)ofHLA-Ainthesampleswerecalculatedandtheirvalueswere0.8705，0.8491，0.6014，and0.9475，respectively.Hanpopulation，especiallytheallelesubtypescharacter,willbeofgreatinterestforclinicaltransplantation,disease-associatedstudyandforensicidentification.Implementationofhigh-resolutiontypingmethodsallowsasignificantlywiderspectrumofHLAvariationincludingrarealleles.Thisrpectrumwillfurtherbeextensivelyutilizedinmanyfields.

简介：High-throughputSNPgenotypingplatformsuseautomatedgenotypecallingalgo-rithmstoassigngenotypes.Whilethesealgorithmsworkefficientlyforindividualplatforms,theyarenotcompatiblewithotherplatforms,andhaveindividualbiasesthatresultinmissedgenotypecalls.HerewepresentdataontheuseofasecondcomplementarySNPgenotypeclusteringalgorithm.ThealgorithmwasoriginallydesignedforindividualfluorescentSNPgenotypingassays,andhasbeenopti-mizedtopermittheclusteringoflargedatasetsgeneratedfromcustom-designedAffymetrixSNPpanels.Inananalysisofdatafroma3Karraygenotypedon1,560samples,theadditionalanalysisincreasedtheoverallnumberofgenotypesbyover45,000,significantlyimprovingthecompletenessoftheexperimentaldata.Thisanalysissuggeststhattheuseofmultiplegenotypecallingalgorithmsmaybead-visableinhigh-throughputSNPgenotypingexperiments.ThesoftwareiswritteninPerlandisavailablefromthecorrespondingauthor.

简介：一个新奇高产量的系统，为分离和反应(4SR)叫了叠的片胶化系统，为DNA/RNA和蛋白质/肽的分析被开发。系统提供利用叠的片胶化的性质的一条新奇三维的胶化电气泳动途径。它同时允许多重样品反应以及被分开，出现一二维(mxn)样品装载系统。为这个目的，包含井(在这篇论文的100口井)的可变数字的高产量的多微的容器(MMV)被使用了，它用25公里做的是方形尺寸的polyacrylamide胶化。在electrophoretic分离以后，而且，包含一件需要的样品的片胶化能容易被移开并且继续到下一步。不同生物反应以及产品的连续分离有效地被执行处理DNA/RNA和蛋白质/肽。它证明这个系统有多种潜力被发展。

简介：