简介：摘要目的使用RNA测序技术比较原发性开角型青光眼(POAG)与正常人小梁网组织基因表达谱的差异，探讨POAG可能的基因学病因。方法实验组小梁网组织来自汕头国际眼科中心行小梁切除术的3例POAG患者，对照组小梁网组织来自汕头眼库的2例非POAG供体眼球。提取2个组小梁网组织RNA进行测序获得基因表达谱，用R软件包edgeR分析实验组与对照组基因表达的差异，用DAVID生物信息分析网站对差异基因进行基因本体(GO)及功能注释聚类分析。采用KOBAS 3.0进行PANTHER富集通路分析，揭示POAG可能的基因学病因。结果(1)RNA测序共得到28 821条基因，2个组间有统计学差异的基因22条[错误发现率(FDR)<0.05]，其中转录表达上升的基因1条，转录表达下降的基因21条；(2)表达差异的基因功能集中，生物学过程涉及角化、表皮发育、中间丝细胞骨架组织等，细胞成分涉及角蛋白丝、中间丝、细胞外泌体、触珠蛋白－血红蛋白复合体等，分子功能涉及结构分子活性、细胞骨架结构组成等；(3)与差异基因相关的PANTHER富集通路主要包括纤溶酶原激活级联反应、p38 MAPK、氧化应激反应及p53通路等。结论角蛋白表达异常、中间丝细胞骨架结构改变、血纤维蛋白溶酶原激活级联反应以及p38 MAPK等通路调控改变引起的小梁网及细胞外基质重塑可能是POAG发病的原因。其中，与发病机制相关的差异基因主要包括细胞骨架相关基因及细胞外基质重塑相关基因，细胞骨架及细胞外基质可作为青光眼治疗的靶组织。

简介：摘要目的鉴定Ⅰ型Stickler综合征一家系的致病突变。方法采用家系调查研究方法，收集2012年6月在汕头国际眼科中心就诊的来自中国潮汕地区的Ⅰ型Stickler综合征一家系。对参与调查的家系成员进行病史采集及临床检查，包括视力、眼压、裂隙灯显微镜和眼底检查等，并由经验丰富的临床医生进行诊断。采集该家系5例患者和4名表型正常者的外周静脉血各5 ml并提取基因组DNA；采用全外显子测序技术及相关生物信息学筛查方法对先证者父亲Ⅲ-5进行全外显子测序及致病突变筛选；采用Sanger测序对突变进行验证；采用SIFT、Polyphen2、MutationTaster分析变异位点致病性；采用氨基酸多序列比对及UniProt结构域预测分析变异位点氨基酸保守性及蛋白质三维结构。结果该家系为常染色体显性遗传方式。共4代39人，其中患者15例，表型正常者24人。先证者Ⅳ-4右眼高度近视、视网膜脱离、斜视，左眼盲；患者Ⅲ-5右眼高度近视、白内障，左眼眼球萎缩；患者Ⅳ-9双眼高度近视。患者Ⅲ-5全外显子测序结果显示，COL2A1基因26号外显子c.1693C>T：p.565Arg>Cys位点变异。Sanger测序分析结果显示，COL2A1突变仅存在于被检患者中，未出现在表型正常者中，符合家系共分离。该变异位点经SIFT、Polyphen2、MutationTaster预测分析为有害性突变，COL2A1蛋白氨基酸序列第565位精氨酸在人、小鼠、大鼠、牛、非洲爪蟾中高度保守，此氨基酸位于该基因的三螺旋功能结构域，此突变使蛋白质在三螺旋重复区域Gly-X-Y发生了变化，X位置的精氨酸残基变为半胱氨酸残基，影响纤维蛋白功能，从而产生致病性。结论COL2A1基因c.1693C>T变异为该家系的致病基因变异位点，该变异位点首次在国内报道。