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  • 简介:摘要目的分析柳州地区2015年1月至2016年10月在我院就诊并采集共10287例肠道病毒病原特征,为柳州地区手足口病(HFMD)的预防和治疗提供科学依据。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽拭子、粪便拭子,用PCR-荧光探针法对肠道病毒分型。结果肠道病毒EV71、CoxA16、EV阳性率分别为4.43%、10.79%、68.49%。1~2岁儿童阳性数占72.5%,发病高峰处于5月份。结论我院2015-2016年手足口病患者检出的肠道病毒主要为CoxA16,其感染率高于EV71型,提示对CA16型肠道病毒引起注意,0~4岁儿童发病率最高,发病高峰期为5~6月份,有明显季节性。

  • 标签: 手足口病 肠道病毒 EV71 CoxA16 病原学
  • 简介:摘要目的对河池市2010年流感病毒进行病原,及时了解河池市流感病毒优势株的变化,分析预测流感流行的趋势和特点,为流感防治提供科学依据。方法采集监测哨点医院、流感疫情常规监测流感样病例的咽拭子标本,先用real-timePCR法完成流感病毒核酸检测,病毒核酸阳性标本再用MDCK细胞进行病毒分离。结果2010年共检测标本490份,流感病毒核酸阳性75份,检出率为15.31%;其中B型60份,季节性流感H3亚型3份,甲型H1N1流感12份;75份病毒核酸阳性标本经MDCK细胞培养后,有2份阳性,阳性率为2.67%,其中甲型H1N1流感1株,B型(Yamagata系)1株。结论2010年河池市有甲型H1N1流感、B型流感及季节性流感H3亚型流感病毒共同流行,流行特点是春季、夏季两个高发季节,流行优势株为甲型H1N1流感和B型流感病毒,1月以甲型H1N1流感病毒为流行优势株,4~7月以B型流感病毒为流行优势株,8月份后则各型流感病毒活动明显减弱。

  • 标签: 流感病毒 监测 病原学
  • 简介:摘要目的了解2019年云南省曲靖地区手足口病(HFMD)病原特征。方法采集曲靖地区2019年HFMD患儿的粪便样本,从粪便悬液中直接提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒(EV)VP4区基因并测序,序列在GenBank确定病毒型别,用各型病毒的相关引物扩增病毒VP1区全序并测序,通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping Tool Version 0.1)进行病毒型别初步鉴定,之后计算与原型株的核苷酸相似性并进行基因进化树分析定型。结果470份样本中共检测到62株EV毒株,总阳性检出率为13.19%,其中EV-A组病毒42株(8.94%),EV-B组病毒9株(1.91%),EV-C组病毒11株(2.34%),全为脊灰病毒1型疫苗株(Sabin株),未检测到肠道病毒71型(EV-A71)和EV-D组病毒。检出率较高的病毒依次为柯萨奇病毒A10型(CV-A10,4.47%,21株)、柯萨奇病毒A16型(CV-A16,2.55%,12株)、脊髓灰质炎病毒1型疫苗株(2.34%,11株)和CV-A6(1.70%,8株)。结论2019年云南省曲靖地区儿童HFMD病例的主要病原是CV-A10、CV-A16和CV-A6,未检出EV-A71。与往年国内其他省份相比,曲靖地区2019年HFMD病原体已经发生改变,今后要加强对CV-A10、CV-A16和CV-A6等病原的实验室监测工作。

  • 标签: 手足口病 柯萨奇病毒 VP1基因 病原体 监测
  • 简介:天津市1999年报告急性弛缓性麻痹病例17例,从1名患儿分离到脊髓灰质炎3型(PⅢ)病毒,阳性率为5.9%;自1名患儿分离到非脊灰肠道病毒(NPEV),阳性率为5.9%。同时采集了96名密切接触者及22名健康人的粪便标本,从中分离到病毒15株,分离率为12.7%,其中3株为PⅢ病毒,其余12株为NPEV。

  • 标签: 天津 1999年 急性弛缓性麻痹 病原学 监测 脊髓灰质炎
  • 简介:摘要目的对2013年至2016年永州市流感病原结果进行分析,旨在了解流感流行趋势,为进一步科学合理地预防控制流感提供相关依据。方法对流感监测点医院所收集流感样病例(ILI)采集咽拭子,以MDCK细胞进行病毒分离,采用血凝(HA)及血凝抑制(HI)方法进行毒株型别鉴定。根据所采集流感样病例对病原数据进行研究分析。结果从2013年至2016年4年间,收集到流感样病例标本共计2483份,经病毒分离和分型鉴定的流感病毒168株,总分离培养阳性率占比6.77%;这4年中H3N2亚型流感病毒流行活跃,在2014-2015年度成为优势流行株,2013年-2016年则是B型、H3N2亚型两种病毒交替流行;新甲型H1N1流行态势较低;在每个监测年份中流感病毒在冬季呈现流行高峰期,有两个年度在夏季呈现流行小高峰期,主要以H3N2亚型流感病毒为主;从年龄段分析,流感病毒以5-15岁年龄组分阳性率最高。结论永州市2013年至2016年间流感病毒流行态势整体维持平稳;每年流感主要在冬春季节流行,夏季流感偶尔呈现流行小高峰,H3N2亚型病毒在几个年份中流行趋于活跃。重点做好冬、春两季流感预防控制工作,对H3N2亚型流感病毒流行态势与病原变化做好监督,可及时研究分析是否存在发生流感病毒变异情况。

  • 标签: 流行性感冒 病原学监测 分析
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  • 简介:摘要目的分析广州市2017-2018年流感疫情的流行特征,为流感疫情的防控提供参考依据。方法采集2017-2018年流感疫情标本,采用多重实时荧光定量PCR方法检测流感病毒核酸。使用EXCEL 2010和SPSS 16.0软件进行数据统计和分析。结果2017—2018年共采集流感疫情标本4 298份,流感病毒核酸阳性率为41.14 %。2017年和2018年均呈现双峰流行的特点,其中2017年流行高峰出现在5—8月和10月—次年1月,2018年流行高峰较2017年提前1至2个月,出现在3—6月和10—次年2月。2017年疫情流行株为甲型H3N2亚型和B型流感病毒,2018年疫情流行株为甲型H1N1流感病毒。0~19岁年龄组B型流感病毒为主要流行病原,20~29岁年龄组A型流感病毒为主要病原。幼儿园中A型流感病毒为主要病原,小学和初高中B型流感病毒为主要病原。不同年龄组的流感病毒核酸阳性率有统计学意义(P<0.01),不同性别组流感病毒核酸阳性率差异无统计学意义(P=0.373)。结论广州市2017—2018年流感疫情呈双峰流行,高峰期出现在4—7月和10—12月,不同流感型别交替流行,不同年龄组感染情况差异有统计学意义。

  • 标签: 流感 疫情 流行特征
  • 简介:目的了解2016年长春市手足口病的流行特点,为及时防治手足口病工作提供科学依据。方法采用实时定量PCR(Real-timePCR)法对手足口病例标本进行核酸检测。结果2016年1月-12月共采集623份病例标本,阳性率为64.53%,高发期在5-10月,其中95.02%病例在6岁以下。结论长春市2016年手足口病原的优势株为柯萨奇6型(CA6),其次是柯萨奇CA16型及其他非EV71和非CA16型。

  • 标签: 手足口病 PCR CA6 CA16
  • 简介:摘要目的分析2015年至2019年佳木斯市儿童流行性感冒(流感)样病例病原特征,为佳木斯市儿童流感的防控提供科学依据。方法选取本中心2015年4月1日至2019年3月31日采用实时荧光定量PCR法检测流感样病例样本3 265份,进行流感病毒核酸检测。结果2015年至2019年佳木斯市儿童甲型流感病毒阳性率比较,差异有统计学意义(χ2=45.055,P<0.05);各年度间乙型流感病毒的阳性率比较,差异有统计学意义(χ2=92.955,P<0.05);2016年至2017年甲型流感病毒阳性率最高13.71%(129/941),2015年至2016年乙型流感病毒阳性率最高8.31%(67/806);阳性分布集中在每年10月至次年3月;甲型H1N1、H3N2和乙型BY、BV均有流行;年龄分布以0~3岁年龄组阳性率最高14.54%(138/949),流行型别以甲型流感为主,各年度男性阳性率为12.30%(217/1 764),女性阳性率为13.26%(199/1 501),男女阳性率之间比较差异无统计学意义(χ2=0.667,P>0.05)。结论2015年至2019年佳木斯市儿童流感甲乙两型均有流行,除2015年至2016年度乙型流感病毒为优势株外,其他年度优势株均为甲型流感病毒;流行季节在冬春季,重点关注婴幼儿流感的发病情况。

  • 标签: 儿童 流感样病例 核酸检测 实时荧光定量PCR
  • 简介:摘要目的了解抚顺市2009—2013年度流感病毒分型及流行特征。方法采用细胞培养法分离流感病毒。结果抚顺市2009年9月至2013年3月在2240份流感样样品中,经RT-PCR检测流感核酸阳性样品为255份,各型流感病毒核酸检测总阳性率为11.38%,分离出毒株为97株,分离流感毒株阳性率为38.04%,而且每年的流行优势毒株均不相同。

  • 标签: 流感病毒 病毒分离 监测
  • 简介:摘要目的分析2016年咸阳市735例手足口病的流行特征,为手足口病防控工作提供科学依据。方法对2016年咸阳市网络报告的735例手足口病的流行病学数据和病原检测数据进行分析。结果咸阳市13个县区均有病例报告,主要集中在人口较多的市区附近;本年度以COXA6病毒为主要病原体(占25.44%),且病例变化有较明显的季节性(4月开始增多,高峰出现在5-7月)。结论咸阳市2016年手足口发病数较多,有明显的季节性,提示我们应该做好春季的手足口病防控工作,还应加强冬季该病的宣传力度和监测力度,及时准确做好防控工作。

  • 标签: 手足口 流行病 分析
  • 简介:1985~1990年采集广州市临床诊断为登革热(DF)病人血清和捕捉当地蚊媒,应用C~6/36白纹伊蚊细胞系分离病毒血清学检测,结果表明:(1)1985年DF流行期间分离得5株DF1型病毒,其中1株从白蚊伊蚊分离获得,首次证实白纹伊蚊是广州市DF流行的传播媒介。(2)1986~1987年DF流行期间分离得39株DF2型病毒,还从致乏库蚊分离得1株DF2型病毒和4株非DF虫媒病毒(电镜鉴定属披膜病毒)。(3)1988年~1989年从疑似DF病人的病原、血清学及蚊媒监测均表明这两年广州未有DF发生。(4)1990年在DF流行期间分离得14株DF4型病毒,其中从疫区白纹伊蚊、致乏库蚊各分离得1株DF4型病毒。通过5年系统监测,初步了解广州DF流行规律和特点。

  • 标签: 登革热病媒 病原学监测 血清学监测
  • 简介:目的通过对2013-2014年北京市门头沟区流感流行季病原分析,明确门头沟区2013-2014年流感流行株、毒株变异情况以及流感病原的特征,为流感疫情防控提供科学依据。方法将流感样病例(ILI)的咽拭子标本进行流感病毒核酸检测,并利用狗肾细胞(MDCK)进行病毒分离检测,病毒分离后采用血凝试验方法(HA)判断是否有病毒存在,并利用实时荧光定量PCR法进行流感病毒型别的鉴定。结果2013年10月-2014年4月共检测流感样病例(ILI)咽拭子标本452份,核酸阳性的标本为109例(核酸阳性率为24.11%),其中新甲型H1N1共31株、H3N2型34株、乙型BY44株。细胞分离到流感病毒83株(阳性率18.36%),其中新甲型H1N1共26株、H3N2型28株、乙型BY29株。结论门头沟区流感病毒在2013-2014年新型H1N1、H3N2、乙型BY型别均有流行。

  • 标签: 流感 核酸检测 病原学监测
  • 简介:目的了解浙江省临海市2010-2011年手足口病主要病原体型别及分布特征,为手足口病的防控提供病原依据。方法采用实时荧光RT-PCR方法,对哨点医院定期采集的临床诊断病例样本进行肠道病毒(EV)核酸检测和型别鉴定。结果共采集咽拭子样本157份,检出112例EV阳性病例,阳性率为71.34%;其中EV71阳性病例28例,CoxA16阳性病例33例,分别占EV阳性病例的25.00%、29.46%;5岁以下儿童EV感染占所有感染者的95.54%;2010年和2011年儿童EV71和CoxA16阳性率分别为17.44%、24.42%和18.31%、16.90%,差异无统计学意义(P〉0.05);男性病例EV阳性检出率高于女性病例(P〈0.05);重症病例EV71阳性检出率为100%。2010-2011年病原构成呈动态变化特征。结论引起临海市手足口病的主要病原体为EV71和CoxA16;5岁以下儿童是EV感染的高危人群;EV71是引起重症病例的主要病原体。

  • 标签: 手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A16型 实时荧光RT-PCR
  • 简介:摘要目的了解许昌市2011-2013年手足口病重症病例病原体型别和分布特征。方法采集2011-2013年间许昌市本地手足口病重症病例的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液标本,采用Real-TimeRT-PCR法进行病毒核酸检测。结果共采集479例手足口病重症病例临床标本进行检测,检测阳性308例,阳性率64.30%。其中EV71阳性220例,阳性率45.93%;CA16阳性30例,阳性率6.26%;其它肠道病毒阳性58例,阳性率12.11%。不同年份EV71、CA16和其它肠病毒构成不同(χ2=12.537,P<0.05)。结论手足口病重症病例主要由EV71引起;不同流行年份,病原构成不同。

  • 标签: 手足口病 重症 肠道病毒
  • 简介:摘要目的了解2020年云南省曲靖市手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病原分布并分析病原体的基因特征。方法采集曲靖市2020年儿童HFMD病例粪便标本,从便悬液中直接提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒(enterovirus,EV)VP4区基因并测序,序列在GenBank进行BLAST搜索确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增病毒VP1区全序并测序,通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping Tool Version 0.1)进行病毒型别鉴定,按文献下载各病原体VP1区基因型/亚型代表株序列,用MEGA5.2软件构建基因进化树,分析各病原体的基因特征。结果2020年共从460份标本中检测到47株EV,总阳性检出率为10.22%(47/460)。检出的病毒依次为柯萨奇病毒A4型(coxsackievirus A4, CVA4,0.65%,3/460)、CVA6 (7.83%,36/460)、CVA10(0.87%,4/460)和CVA16(0.87%,4/460),全为A组病毒(enterovirus species A,EVA),未检测到其他组病毒,其中CVA6检出36株,占7.83%,是检出最多的病毒。EVA71的检出率为零。基因特征分析表明,CVA4的C2、C4两个基因亚型同时在曲靖市流行,CVA6的D3a亚型、CVA16的B1a亚型也在曲靖市流行,而CVA10单独为一个进化分支,可能为曲靖市特有。结论与往年全国的情况一样,EVA71和CVA16的检出率少甚至为零,而CVA6检出率最高,说明2020年曲靖市发生了以CVA6为主的手足口病流行。CVA10基因进化分析表明,曲靖市分离株位于单独的进化分支,可能是曲靖市特有的分支。今后应加强非EVA71和非CVA16尤其是CVA6和CVA10等病毒的实验室和分子流行病学监

  • 标签: 手足口病 病原学 肠道病毒A组病毒 基因特征分析
  • 简介:摘要人类目前依然面临着细菌性传染病带来的公共卫生挑战。开展系统的传染病监测预警是预防和控制传染病最直接的手段。病原是传染病监测预警的重要组成部分。敏感准确的病原可以在第一时间识别病原、识别暴发、识别来源。本研究对细菌性传染病的病原预警技术研究和应用现状进行综述,总结病原在传染病监测预警中的重要性和应用场景以及病原预警技术研究进展,并在我国现有的国家致病菌识别网等实验室监测网络的工作基础上,提出了传染病实验室网络化监测发展趋势和展望,为建立健全传染病监测预警体系提供参考。

  • 标签: 传染病控制 细菌 预测 病原学监测 分型溯源
  • 简介:摘要目的对2014~2015年上海市手足口病哨点医院-复旦大学附属儿科医院送检的疑似重症手足口病病例样本进行实验室检测分析,探讨疑似重症手足口病在本地区的病原特征,为手足口病的综合防治提供依据。方法收集2014~2015年哨点医院-复旦大学附属儿科医院疑似重症手足口病病例送检的咽拭、粪便、肛拭样本,应用realtimeRT-PCR技术检测肠道病毒通用型(EV)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)、柯萨奇病毒A组6型(CVA6)、柯萨奇病毒A组10型(CVA10),并分析病原体分布特征。结果2014~2015年期间共收集到疑似重症手足口病病例274例,病原检测发现264例肠道病毒检测阳性,阳性检出率高达96.35%。其中EV71和CVA16分别占95.45%、3.03%,其他肠道病毒占1.52%,主要病原体为EV71病毒;对264例病原检测阳性病例的粪便和咽拭配对标本进行检测,粪便标本检出率为98.86%,咽拭标本检出率为59.85%,McNemar检验比较两种样本检出率的差异,P<0.01,粪便标本的检出率高于咽拭标本。病例人群男性高于女性(1.981),主要发病年龄为5岁以下的婴幼儿,病例集中在1~3岁低幼年龄组,疑似重症手足口病发病高峰主要集中在4~7月份。结论疑似重症手足口病主要的发病季节为春夏季;多发于5岁以下儿童;男性人群的发病率高于女性人群;EV71型是2014~2015年本地区手足口病流行的优势毒株,其流行具有明显的年龄和季节性特征。

  • 标签: 重症手足口病 肠道病毒71 柯萨奇病毒16