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127 个结果
  • 简介:目的:对目前最常用的检测微小RNA(miRNA)的茎环实时定量PCR法和PAP实时定量PCR法进行比较。方法:分别用茎环实时定量PCR法和PAP实时定量PCR法检测人乳腺癌细胞MCF-7中U6和23种miRNA的表达,利用定量PCR分析软件和琼脂糖凝胶电泳方法,将2种方法在引物设计难度、特异性与灵敏度,以及检测通量方面进行比较。结果:茎环法的特异性和灵敏度比PAP法高,但引物设计难度大,检测通量低;PAP法引物设计难度较低,检测通量较高,但特异性和灵敏度较差。结论:茎环法实时定量PCR适于有针对性地检测小规模miRNA,而PAP法则适于大规模miRNA筛选实验。

  • 标签: 微小RNA 茎环实时定量PCR PAP实时定量PCR 检测
  • 简介:mirVanaqRT-PCRmiRNA检测试剂盒扩增特定的小RNA,可以精确定量小RNA表达水平。这个测定系统还可以通过传统的RT-PCR或实时RT-PCR使用SYBRGreen1描述小RNA表达特征。引物组也几乎涵盖人、大鼠、小鼠的微小RNA。另外,引物组特别含有小RNA-U6snRNA和5srRNA,它们可以控制输入的变异性和样本标准化。

  • 标签: 小RNA 检测试剂盒 测定系统 引物 RT-PCR SNRNA
  • 简介:Hybridoma房间在抗体生产率追随者暴露显示增加到张力亢进的条件。然而,内在的机制很好没被理解。在现在的学习,我们假设激活的T房间的原子因素5(NFAT5)/tonicityenhancer绑定蛋白质(TonEBP)工作增加hybridomacells的抗体生产率。NFAT5是osmosensitive哺乳动物的抄写因素。然而,它在没在张力亢进的周围被洗的各种各样的器官的无所不在的表示建议NFAT5可以也在等渗的条件下面调整细胞生长和功能。在这研究,我们由西方的污点分析在hybridoma房间检验了表示ofNFAT5,并且发现它在张力亢进的媒介显著地增加了。为了推进,在hybridoma房间定义NFAT5的功能,RNA干扰技术习惯于down在SGB-8房间(一根hybridoma房间线)调整NFAT5的表示。在等渗的媒介,hybridoma房间的抗体生产率被NFAT5while的down规定减少细胞增殖没被影响。这里介绍的结果表明那NFAT5不仅在hybridoma房间在渗透的压力反应小径起一个重要作用而且为最佳的抗体生产率是必要的。

  • 标签: 杂交瘤细胞 单克隆抗体产率 RNA干扰 NFAT5转录因子 减量调节
  • 简介:目的:检测前列腺癌及癌旁正常前列腺组织中RNA结合蛋白QKI-5的表达情况并分析其临床意义。方法:收集前列腺癌及与之匹配的癌旁组织124例,通过免疫组化染色、Westernblot、实时PCR方法检测其QKI-5的表达水平,并分析QKI-5的表达与前列腺癌临床病理特征的关系。结果:前列腺癌组织中QKI-5蛋白及mRNA表达水平均明显低于癌旁正常前列腺组织,并且随着Gleason评分的增高而降低(P〈0.05)。前列腺癌组织中QKI-5的表达与其Gleason评分(r=-0.939,P〈0.05)、TNM分期(r=-0.913,P〈0.05)、血清PSA值(r=-0.743,P〈0.05)均密切相关。结论:QKI-5在前列腺癌的发生发展过程中可能起抑癌基因的作用,并可能作为前列腺癌的诊断、病情分析和预后评估的参考指标。

  • 标签: RNA结合蛋白QKI-5 前列腺癌 表达 WESTERN BLOT
  • 简介:RNAi是指通过双链RNA介导特异性降解靶mRNA,导致转录后水平基因沉默的现象。其作用途径有RdRP依赖的RNAi的途径与非RdRP依赖的RNAi途径2种。利用RNAi的基因敲除技术在dsRNA序列选择、质粒或病毒为载体的dsRNA体内合成、发夹样siRNA的转录、dsRNA的导入方法等方面取得了很大进展,在研究人类或其他生物基因组中未知基因及蛋白质的功能等领域具有诱人的应用前景。

  • 标签: RNA干扰 基因敲除 转录后基因沉默 小干扰RNA MRNA
  • 简介:RNaseMRPRNA是处理的RNasemitochondrialRNA(MRP)的RNA子单元涉及处理事件的多重细胞的RNA的酶建筑群。RNaseMRPRNA基因(RMRP)上的变化引起后退地继承的发展混乱,软骨头发发育不全(CHH)。遗传型(RMRP变化)的关系,RNaseMRPcomplex的RNA处理缺乏,和CHH和另外的骨胳的发育异常的显型还有待于被探索。

  • 标签: 核糖核酸酶线粒体加工 RNASE MRP RNA 遗传病 软骨-毛发发育不全
  • 简介:Heterogeneousnuclearribonucleoproteins(hnRNPs)arespliceosomalmacromolecularassemblagesandthusactivelyparticipateinpre-mRNAmetabolism.Theyarecomposedofevolutionarilyconservedandtandemlyrepeatedmotifs,wherebothRNA-bindingandprotein-proteinrecognitionoccurtoachievecellularactivities.Byyetunknownmechanisms,theseribonucleoprotein(RNP)particlesaretargetedbyautoantibodiesandhenceplaysignificantroleinavarietyofhumansystemicautoimmunediseases.Thisfeaturemakesthemimportantprognosticmarkersintermsofmolecularepidemiologyandpathogenesisofautoimmunity.SinceRNPdomainisoneofthemostconservedandwidespreadscaffolds,evolutionalysesoftheseRNA-bindingdomainscanprovidefurthercluesondisease-specificepitopeformation.ThestudypresentedhereinrepresentsasequencecomparisonofRNA-recognitionregionsofrecentlyclonedandcharacterizedhumanhnRNPA3withthoseofotherrelevanthnRNPA/B-typeproteins.Theirimplicationsinhumanautoimmunityareparticularlyemphasized.

  • 标签: 异核蛋白 hnRNPs 分子进化 mRNA 新陈代谢 分子衔接
  • 简介:在不到10年里自从它的开始,RNA干扰(RNAi)在生物医学的科学上有非凡的影响。RNAi被表明了到影响众多生物并且疾病小径。RNAi技术的开发和采纳是丰富的从基本loss-of-function工具,到药品的目标确认的染色体宽的屏蔽图书馆和治疗学的开发。然而,RNAiis的分子的机制理解远非完全。这简短评论的目的是在阐明加亮关键成就导致RNA的silencing建筑群并且到的生化学机制为这块地构画出主要挑战。

  • 标签: RNA诱导沉默复合物 生物化学机制 致活 RNA干扰 SIRNA
  • 简介:死亡联系域的蛋白质Daxx施加包括调停的许多报导功能经由激活c6月N终端从FasL发信号到apoptosisapoptosis的kinase(JNK),正式就职和抑制,和染色质改变的规定。它原来从酵母被克隆用船边交货对相似物体之连续感觉而形成心像口的细胞内部的尾巴的二混血儿的屏幕诱饵。而许多起始的报告仍然保持争论,Daxx在一系列压力信号包括UVirradiation,过氧化氢治疗和TGF-β治疗触发的apoptosis的规定起重要作用,是清楚的。在这评论,我们在Axinbeing上集中连接Daxx到p53的一个拴住的因素。

  • 标签: 抑癌基因 AXIN 转录调控蛋白 DAXX P53 功能性连接
  • 简介:CCAAT/enhancer有约束力的蛋白质α(C/EBPα)是transcriptional禁止细胞增殖的规章的因素,和其他的翻译开始生产二多肽,C/EBPαp30并且C/EBPαp42。由表示介绍,C/EBPαp30specifically禁止了基因的一个唯一的集合,这被揭示,包括MPP11,p84N5和SMYD2,它没被C/EBPαp影响42在两根QSG-7701hepatocyte房间线和QGY-7703hepatoma,cells.Semi量的RT-PCR分析独立地证实了这些结果。Chromatinimmunoprecipitation试金显示出30比C/EBPαp更强烈绑了在这些基因的倡导者的那C/EBPαp42。在C/EBPα是调整的down的临床的hepatoma在样品,所有三基因明确地由30在上面的C/EBPαp禁止了调整。然而,MPP11,p84N5和SMYD2genes的压抑可能直接不涉及C/EBPαp30-mediated生长抑制。我们的数据建议30调整的那C/EBPαp目标基因的一个唯一的集合并且多于C/EBPαp的dominant-negativeregulator42。

  • 标签: CCAAT增强子结合蛋白 C/EBPαp30 C/EBPαp42 转录调节作用 表达模式
  • 简介:在目前的疫苗研究中,对新疫苗免疫效果的要求越来越高。减毒或无毒的病毒疫苗载体能够激发高效持久的系统和黏膜免疫,并且具有较高的安全性,为研究新疫苗提供了一条途径。RNA病毒作为疫苗载体,在可操作性和免疫效果方面有着显著的优势,近年来已成为疫苗研究领域的热点。综述了几种RNA病毒载体目前的研究状况及其在疫苗载体方面的应用。

  • 标签: RNA病毒 载体 疫苗
  • 简介:Inordertostudythefunctionalstructureofthetranscriptionterminatorsandthemechanismoftemination,asurveyofthechromatinstructure,includingthelocationofDNaseIhypersensitivesitesandthenucleosomearrangement,ofyeastADH1andFLPterminatorswasmade.TheresultsshowthatthereisnorelationshipbetweenthefunctionoftheterminatorsandtheexistenceofDNaseIhypersensitivesites.However,itisfoundthatthereisalwaysanucleosmoeattheimmediateupstreamofthetranscriptionalterminationsites.Asacontrol,thechromatinstructuresofthepBR322DNAfragmentsontheyeastshuttervectorsarealsoinvestigatedatthesametime.TherandomnucleosomearrangementonthebacterialDNAinyesastagreeswiththepublishedreports.Anewhypothesis,aboutthemechanismoftranscriptionalterminationisputforwardandthereasonofdifferentnucleosomearrengementontheDNAswhichareoriginallyfromdifferentspeciesinyeastisdiscussed.

  • 标签: 酵母 RNA聚合酶Ⅱ 转录终止点 染色质结构
  • 简介:很多小RNA病毒科病毒感染宿主细胞后可引发宿主细胞凋亡,这种现象被认为是宿主细胞对抗小RNA病毒侵染的防御机制。凋亡机制可由某些病毒蛋白对细胞产生信号干扰来实现多种凋亡通路。虽然这些凋亡通路的上游事件是不同的,但最后的效应却很一致。此外,一些病毒蛋白具有抑制细胞凋亡的功能,它们能够令感染病毒后的细胞不死亡,形成病毒与宿主细胞共存的持续性感染状态。

  • 标签: 小RNA病毒 细胞凋亡 持续性感染
  • 简介:目的:通过对TRIzol一步法进行改进,建立一种从富含胶原蛋白、多糖及色素的仿刺参体壁提取总RNA的有效方法。方法:样品在液氮中研磨并用TRIzol匀浆后再进行抽提;对TRIzol一步法提取的总RNA进行DNaseⅠ消化和酚氯仿抽提,用2.5mol/L的醋酸钾沉淀,并加入适量糖原(10mg/mL)与RNA共沉淀。结果:琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法以及RT-PCR检测结果表明,改进的方法能够有效去除基因组DNA、蛋白、多糖及色素的污染,RNA的产率提高。结论:制备的总RNA纯度高,完整性好,能够满足mRNA差异显示RT-PCR等分子生物学研究的要求,是一种提取仿刺参体壁及其他富含黏多糖、胶原蛋白和色素的动物组织总RNA的有效方法。

  • 标签: 仿刺参 体壁 总RNA提取
  • 简介:比期望,非编码的RNA(ncRNA)基因才是更众多的。然而,与计算算法或生物实验识别ncRNAs仍然是一项困难的任务。最近的报告建议了ncRNAs可以也出现在表示顺序标签(EST的)数据库。不过,内部遗传因子的EST几乎没收到很少注意并且糟糕由于他们的低丰富被注解。这里,我们为从人的EST发现ncRNA基因开发了计算策略。我们首先收集了位于的EST内部遗传因子的区域并且别让详细注解。内部遗传因子的区域被划分成非重叠的50-nt窗口,从UCSC数据库获得的PhastCons分数被分到这些窗口。我们使有超过0.8的PhastCons分数并且有至少三支持EST充当种子的窗户保存。相应于种子的EST的每簇被装配进长contig。我们使用了二个标准从这些contigs为ncRNA抄本屏蔽:第一是最长预言的开的读物框架是不到300nt,第二是可能的Pol-II倡导者在contigs在上游或下游的2,000nt以内存在。作为结果,118新奇ncRNA基因从人的低丰富EST被识别。七个随机选择的候选人,六在由RT-PCR出现的人的2BS房间被抄录。我们的工作证明EST为检测新奇ncRNA基因是“隐藏的财富”。

  • 标签: NCRNA EST 计算机识别 标志序列 RT-PCR
  • 简介:Humantumornecrosisfactorα(hTNFα),apleiotropiccytokinewithactivitiesrangingfromhostdefensemechanismsininfectionandinjurytoseveretoxicityinsepticshockorotherrelateddiseases,isapromisingtargetfordrugscreening.UsingtheSELEX(systematicevolutionofligandsbyexponentialenrichment)process,weisolatedoligonucleotideligands(aptamers)withhighaffinitiesforhTNFα.Aptamerswereselectedfromastartingpoolof40randomizedsequencescomposedofabout1015RNAmolecules.RepresentativeaptamersweretruncatedtotheminimallengthwithhighaffinityforhTNFαandwerefurthermodifiedbyreplacementof2'-OHwith2'-Fand2'-NH2atallribopurinepositions.ThesemodifiedRNAaptamerswereresistanttonuclease.ThespecificityoftheseaptamersforhTNFαwasconfirmed,andtheiractivitytoinhibitthecytotoxicityofhTNFαonmouseL929cellswasdetermined.Resultsdemonstratedthatfour2'-NH2-modifiedaptamersboundtohTNFαwithhighaffinityandblockedthebindingofhTNFαtoitsreceptor,thusprotectingtheL929cellsfromthecytotoxicityofhTNFα.OligonucleotideaptamersdescribedherearepotentialtherapeuticsanddiagnosticsforhTNFc-relateddiseases.

  • 标签: HTNFΑ 人肿瘤坏死因子Α 相似法则 RNA 核糖核酸 低聚核苷酸配位子
  • 简介:以田间幼嫩叶片为试材,建立枣RNA改良CTAB提取法,改良之处包括利用巯基乙醇和PVP联合去除多酚、CTAB与异硫酸氰胍联合促进RNA释放及加入糖原提高产率等。改良CTAB法提取液组成:2%CTAB,4mol/L异硫酸氰胍,100mmol/LTris-HCl(pH8.0),20mmol/LEDTA(pH8.0),2%PVP,4%β-巯基乙醇,250μg/ml糖原。进而采用Trizol试剂法、改良CTAB法、改进SDS-酚法、热硼酸法和异硫氰酸胍法5种方法分别对枣组培苗、幼叶、幼嫩枝皮、根皮和枣果5种器官和组织进行了总RNA提取。结果表明,组培苗RNA提取以Trizol试剂法为最佳,田间幼叶和成熟果实宜采用改良CTAB法,幼嫩枝皮和根皮宜采用改良CTAB法或改进SDS-酚法;本研究建立的改良CTAB法可作为枣不同器官和组织RNA提取的通用方法;根据季节可从不同器官和组织中获得高质量RNA;枣组织RNA含量相差较大,以幼嫩叶片含量最高,其次为组培苗、枝皮、枣果和根皮。

  • 标签: 器官 组织 总RNA提取