摘要
摘要目的通过基因共表达网络筛选与结直肠腺癌(COAD)发展相关的关键基因，并初步验证其潜在功能。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载COAD患者基因表达谱和临床信息，包括379例COAD患者及39例对照，Kaplan-Meier分析得到COAD预后相关基因后进行权重基因共表达模块(WGCNA)分析；最终获得关键基因后结合分子实验初步验证其功能及潜在机制；多组均数比较采用Kruskal-Wallis检验、两组均数比较采用Mann-whitney U检验，相关性分析使用Pearson检验。结果共筛出3 170个预后相关基因；WGCNA构建出9个基因模块，其中Brown模块不仅与COAD呈负相关，且与临床分期、TNM分期呈负相关；Brown模块的中心基因C4orf19在COAD肿瘤组织中表达低于对照组[4.37 (4.10～4.49)比2.70 (2.18～3.18)，U＝684，P<0.01]，并且与临床分期(H＝9.442，)、T分期(H＝9.336)、M分期(U＝5 842)和N分期(U＝14 572)相关(P均<0.05)；免疫组织化学示C4orf19在癌组织组表达低于癌旁组，阳性例数分别为11(27.5%)和35(87.5%)，差异有统计学意义(χ2＝29.460，P<0.01)；沉默C4orf19后，结肠癌细胞增殖(4.494±0.438比3.415±0.453，t＝-4.527)、迁移(15.007±0.439比7.583±0.701，t＝12.69)及侵袭能力(154.000±4.546比96.667±4.643，t＝12.48)高于对照组(P<0.01)。结论WGCNA是一种有效的系统生物学方法，通过此方法识别出新的抑癌基因C4orf19。
出版日期
2021年09月05日（中国期刊网平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
